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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

[交流] 关于真核基因表达的宿主菌的选择的问题

最近在做一个真核基因的表达实验,用大肠杆菌BL21(DE3)表达效果不好。
从密码子偏爱性方面进行分析,
所用工具为网站http://gcua.schoedl.de/上的 codon vs. usage table
目的基因密码子分别与Escherichia_coli和pichia pastoris相比较,发现Escherichia_coli效果要更好。(即可能会影响基因表达的密码子与Escherichia_coli比较时个数要少)
虽然没有做在目的基因在酵母中的表达,也没有比较二者表达量是否与分析的结果相符。
但是想问问,在宿主菌的选择方面,是否真核基因选择真核宿主菌要好于原核宿主菌。(仅从表达量上)
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Thank-you,so-blue.
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jiaminl

铁杆木虫 (知名作家)


susizheng(金币+1,VIP+0):谢谢 5-13 11:53
没做过不是很清楚 帮忙顶
Nevergiveup!
2楼2009-04-24 15:43:47
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elvias

铁杆木虫 (正式写手)


susizheng(金币+1,VIP+0):DH5a不是专门用来表达的菌株,不过也有人的确表达出来了。可以考虑下。 4-24 17:28
你可以尝试用DH5a来表达,有时也是可以表达出来的。
我就有蛋白是用DH5a来表达的。
3楼2009-04-24 16:44:58
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anik

银虫 (正式写手)


susizheng(金币+1,VIP+0):谢谢 4-27 13:01
物品也遇到过这种问题,BL21 表达不是菌体的事,是基因方面的
4楼2009-04-24 17:47:09
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elvias

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
susizheng(金币+1,VIP+0):谢谢 4-25 09:57
susizheng(金币+3,VIP+0): 5-13 11:54
你说的真核基因选择真核宿主菌要好于原核宿主菌,仅从表达量上来说不一定,真核宿主表达的好处在于,对你表达的蛋白进行修饰,这是原核不能比拟的,但表达量不一定比原核高。
5楼2009-04-25 09:35:50
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
susizheng(金币+1,VIP+0):谢谢 4-25 09:57
susizheng(金币+2,VIP+0): 5-13 11:54
密码子偏爱性跟表达量的相关性很低
6楼2009-04-25 09:44:26
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

问题解决,还有金币版主可以返还吗?
Thank-you,so-blue.
7楼2009-04-27 11:52:05
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