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merlynhuang

金虫 (小有名气)

[交流] 不同软件预测的表位结果不一样。

小弟最近在学着预测某蛋白的B细胞表位,主要是利用在线的工具,http://tools.immuneepitope.org/tools/bcell/iedb_input,但是我不懂的是
Kolaskar & Tongaonkar Antigenicity 预测和Bepipred Linear Epitope Prediction预测到底有什么区别,结果怎么相差那么大呢?
有知道的朋友指点下,谢谢。5个金币小意思一下。
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重新泡论坛,才找回做实验的感觉
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wangayimu

铁虫 (初入文坛)

国际上通用的是什么算法?那个网站呢
4楼2009-04-23 09:43:24
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anik

银虫 (正式写手)


merlynhuang(金币+1,VIP+0):thanks 4-23 13:06
每个工具的算法不一样的,多找几个,然后根据其他的信息选择最贴切的那个。
那些工具不是百分百的正确,是存在概率在其中的。
2楼2009-04-22 23:27:46
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蓝色基因

金虫 (正式写手)


merlynhuang(金币+1,VIP+0):可否说具体些呢? 4-23 13:07
的确,每个软件的算法是不一样的,但大致都遵循一个规律。

所以还是多做几次,加上自己的判断,做出选择。

或者就干脆选现在国际上比较通用的那个,到时发文章时说服力也大一点。
3楼2009-04-23 09:20:39
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