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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助：建进化树的时候如何选择同源序列
汕头大学海洋科学接受调剂
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wangyu8604

新虫 (小有名气)

[交流] 求助：建进化树的时候如何选择同源序列

blast比对后有很多同源序列，建系统发育树的时候应该如何选择同源序列，有没有选择的标准？
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1楼 2009-04-21 20:52:30
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zhyzx

金虫 (小有名气)
生物谷的论坛上有好多进化树的资料，你去搜搜，可能有帮助呢！
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2楼2009-04-21 22:07:28
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xiaozhou_1

铜虫 (初入文坛)
★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):同意 1-20 08:53
一般来说，选择和你的序列相似性最近的但最好是已经有效发表的序列，同时要对你的序列的背景有充足的了解，这就需要相关文献的阅读，你也可以参照一些代表性的文献中用到的序列， 另外，外群的选择也很重要。
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3楼2009-04-21 22:21:07
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695

木虫 (职业作家)
恩，多看看相关文献的方法，或许会有眉目
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4楼2009-04-22 00:28:05
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
★
1949stone(金币+1,VIP+0): 1-20 08:54
Blast比对后有很多同源序列，选择跟你所比对序列相似性最大的序列，将相对应的种作为外类群
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5楼2009-04-22 08:02:37
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wangyu8604

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 欣晴5832 at 2009-4-22 08:02:
Blast比对后有很多同源序列，选择跟你所比对序列相似性最大的序列，将相对应的种作为外类群

一般是不需要建外群的啊。我的问题是BLAST比对后得到很多同源序列，建进化树的时候应该选择哪些序列建树啊？
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6楼2009-04-22 09:02:32
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平子

新虫 (初入文坛)

有用

很好
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7楼2010-01-19 20:31:19
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