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swallow_Qu

金虫 (小有名气)

[交流] 什么统计软件能够进行Mantel-test,就是检验两个矩阵之间相关性的一种方法？

相计算遗传距离与地理距离的相关性，怎么做，请高人指点。
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happy
1楼 2009-04-15 16:39:47
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wpq113

至尊木虫 (著名写手)
★
swallow_Qu(金币+1,VIP+0):谢谢 4-16 09:47
CANOCO可以进行简单的M测验，R程序包可以进行偏R测验
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2楼2009-04-15 17:01:11
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wpq113

至尊木虫 (著名写手)
★
swallow_Qu(金币+1,VIP+0):THANKS 4-16 09:48
TFPGA软件包中有Mantel Test
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3楼2009-04-15 17:03:48
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wpq113

至尊木虫 (著名写手)
★
swallow_Qu(金币+1,VIP+0):THANKS 4-16 09:48
Mantel tests:      Genetix, TFPGA, McMantell软件均可以
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4楼2009-04-15 17:05:35
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wpq113

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
swallow_Qu(金币+3,VIP+0):谢谢，可以发个软件包给我没，不胜感激 4-16 09:51
中国蒙系绵羊品种间的基因流动
右键另存
219.238.6.200/getfile?category=article&code=6-306&file-name=6-306-324.pdf

数据统计方法
统计群体内遗传多样度(HS)、总群体遗传多样度(HT)、遗传分化系数(GST)、基因流(Nm)和标准遗传距离(D)等指标, 并以Mantel test模型[8]分析遗传距离与地理距离之间的相关性。数据的统计主要在POPGENE32[9]和TFPGA[10]软件包上进行。
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5楼2009-04-15 17:13:52
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