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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于编码区问题的请教
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ljbyoyo

[交流] 关于编码区问题的请教

如果我想看看我的引物所扩的片段是在编码区还是在非编码区，应该通过哪些方法？请高手指教！谢谢
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1楼 2009-04-15 08:53:47
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢，欢迎常来生物版~ 4-15 12:36
ncbi对一下序列就知道了
里面有注释exon之类等信息
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2楼2009-04-15 10:58:40
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ljbyoyo

麻烦您能不能再讲的详细一点，我在NCBI理BLAST过以后，找不到exon之类等信息 。
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3楼2009-04-16 20:45:25
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU
先确定你扩增的序列在同源性分析中出处于的位置？然后其他物种中该基因的编码框的情况（dna和cdna,就是楼上说的外显子和内含子，对比一下)，大致可以确定，基因不同有差异的。
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活着就要让人感受到你的存在。
4楼2009-04-16 21:36:58
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU
要分析一下的。

[ Last edited by xujian568 on 2009-4-16 at 21:39 ]
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活着就要让人感受到你的存在。
5楼2009-04-16 21:38:23
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ljbyoyo

"同源性分析中出处于的位置"是指的哪方面，应该要通过BLAST才能看出来吧，处于什么样的位置我理解不了。
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6楼2009-04-17 09:09:12
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ganchao1776

至尊木虫 (职业作家)
你可以先用软件翻译一下，看一下能不能翻译出一个长一点的氨基酸序列出来，要是能的话，你拿那段序列去BLast一下，看能找到什么。要是不能，那就是在非编码区了，翻译的时侯要三个读码框都试一下
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7楼2009-04-18 00:05:00
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