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hora0212

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】问个原子莫名其妙丢失的问题。

我在win下,导入了一个由建立碳纳米管的模块建立的3,3型碳管,经过nanolanguage转到jobmanager里面去算,结果在result里面看,发现所有的原子都不见了,但是能看到轨道图之类我加的analysis。以前有个insert plot-configuration功能的,我这里竟然没有了,但是算自己建立的构型又出现了。请问是怎么一回事?是不是我建立的碳管模型必须要设置下才能不发生这种原子丢失的问题?谢谢

老规矩。5个金币做感谢
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hora0212

铜虫 (初入文坛)

★ ★
zxzj05(金币+2,VIP+0):3Q! 期待更多讨论! 4-15 10:05
问题的进一步描述,只要用纳米管模块建立出来的周期管状结构直接导入计算。出来的总是没有原子,但是转成molecular以后,结果中就会出现结果。但是已经不是周期性结构。
寻求帮助!谢谢!
2楼2009-04-14 15:24:36
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)

楼主可不可以麻烦把脚本和输出文件传纳米盘里然后贴一下~~
3楼2009-04-14 19:21:56
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hora0212

铜虫 (初入文坛)


zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q! 期待更多讨论! 4-15 10:06
引用回帖:
Originally posted by TIGERYZZ at 2009-4-14 19:21:
楼主可不可以麻烦把脚本和输出文件传纳米盘里然后贴一下~~

http://www.namipan.com/d/3%2c3_2 ... f5857d50ad621803701   输出文件在这里,输入文件就是将NANOtube模块建立的碳管直接计算的,麻烦了!
4楼2009-04-15 09:45:44
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qasd(金币+3,VIP+0):xiexie~ 4-15 20:07
hora0212(金币+5,VIP+0):谢谢你的回答!!我试一下。 4-16 15:56
LZ,没有输入文件不好判断是什么问题啊。输出的倒是可以不要……
如果LZ用的是2008.10,那么我猜测可能是下面这种可能性。LZ应该是直接从scripter拖到JOB manager计算的,那么请先拖到sctipt editor里面看一下脚本。
脚本在建立原胞后,仅仅输出了结构,但是并没有写到vnl文件中去:
if processIsMaster(): nlPrint(periodic_atom_configuration)
你可以再这行下面下面的语句将结构写进vnl文件
if processIsMaster(): file.addToSample(periodic_atom_configuration, 'CNT')
希望可以解决你的问题~~
5楼2009-04-15 13:20:02
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