应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物化学 » 分子对接
61/1返回列表
查看: 1093  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Yun XMQ

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接 已有3人参与

请教一下谁知道在进行分子对接时怎样对配体分子进行处理呢？处理依据是什么呢？

@lifeliuyan 发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2018-10-29 19:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sun蔚蓝

新虫 (著名写手)
有一步prepare liagand这一步吧

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2018-10-29 20:31:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不同软件处理方式不同
赞一下 回复此楼
3楼2018-10-30 01:11:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

用autodock处理的话，需要先在chemidraw处理成mol2格式，然后在mgltools里面加氢计算电荷等，保存成pdbqt
赞一下 回复此楼
4楼2018-10-30 01:13:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

推挤你用殷赋云计算平台，画个2D结构式就可以了，平台会自动处理配体，生成优化好的3D结构。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2019-03-25 12:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

只要确保配体分子是良好的3D结构就行了。可以百度搜索【小工具教程 准备化合物结构】，用它处理下。
赞一下 回复此楼
6楼2021-12-29 11:52:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Yun XMQ 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭