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qvshang

木虫 (正式写手)

[交流] let-7 microRNA生物信息学分析

如何进行分析?
分析什么?
希望得到您的回答 谢谢 在线求助

[ Last edited by qvshang on 2009-4-28 at 10:54 ]
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
qvshang(金币+3,VIP+0):对啊 的确啊 老师也没有给个确定的东西啊,我觉得就是要看下let-7的信息和序列这块 但是呢不知道怎么做 4-12 14:46
题目未免太泛……
生物信息学只是一个手段,具体要看你想用这个工具干什么事?
现在反问自己,到底想做什么呢……研究目的是什么呢?
不要说是把miR和bioinfo扯到一起就可以了……
2楼2009-04-12 14:40:32
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


qvshang(金币+1,VIP+0):恩 感觉这个题目把我搞的没有头绪 4-12 14:52
基因分析无非就分那么几块
基因的结构,转录,行为(功能),进化,多态性……
看看你擅长哪一块就做哪一块好了,全部做也可以……
3楼2009-04-12 14:50:30
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

目前是比较热的是miR的binding site的SNP
你可以试着利用HapMap等数据库给做一个分析
4楼2009-04-12 15:21:38
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anquren

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
qvshang(金币+5,VIP+0):谢谢 但是如果做miRNA靶基因的预测 相对来说数据比较单调 这样的话就要对全部的195个成熟的miRNA进行分析了 4-13 10:52
miRNA靶基因的确定是研究miRNA生物学功能的关键内容. 目前有关miRNA靶基因的确定主要靠计算机生物信息学软件预测,然后再利用生物学实验方法去验证。其中生物信息学方法主要根据已证实的miRNA及其靶基因序列,通过分析它们之间相互作用的规律性, 然后编写一些程序来预测。目前预测miRNA靶基因的有miRanda, TargetScan和TargetScanS, RNAhybrid, DIANA-microT, PicTar, RNA22及FindTar等。
楼主作为本科生,选let-7的生物信息学分析为题,最好的题目就是选择靶位基因的预测与分析方面的。
仅供参考。
5楼2009-04-12 21:24:15
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qvshang

木虫 (正式写手)

感谢各位
但是我觉得好像还是搞不懂
6楼2009-04-28 10:55:38
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louyiceng

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主


qvshang(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by qvshang at 2009-04-28 10:55:38:
感谢各位, 但是我觉得好像还是搞不懂

大家帮帮
7楼2010-02-10 12:15:35
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yucheng9255

木虫 (著名写手)


qvshang(金币+1):谢谢参与
不明白楼主的意思
8楼2010-02-10 21:21:30
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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)


qvshang(金币+1):谢谢参与
楼主的问题解决了吗
9楼2010-02-11 08:51:23
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