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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 如何确定LAMMPS的NEB找的是对的过渡态
汕头大学海洋科学接受调剂
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Atmoschem

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何确定LAMMPS的NEB找的是对的过渡态 已有1人参与

向各位请教一下，我在做表面反应机理的时候，用LAMMPS的NEB找了一下过渡态，得到了能垒，但是LAMMPS没有输出过渡态的虚频频率，我也不能看到它沿着反应路径的振动，也不能像Gaussian那样做IRC分析，那么如何确定NEB输出的过渡态就是对的？

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1楼 2018-10-20 09:00:14
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max0906

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+20, 感谢交流 2018-12-10 15:12:09
NEB方法就是在始末状态之间线性的插入若干态（看你设置多少个），每个态最小化计算，对应的能量有个变化趋势吧，是不是像马鞍状？
另外，你设置输出的dump轨迹文件，用ovito能看出来反应路径。
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2楼2018-11-15 22:08:24
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