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冀冀冀冀

铁虫 (初入文坛)

[交流] 能否用分子动力学模拟几微米尺度的仿真 已有2人参与

如题,请各位MD研究者多多指教
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梧桐77

新虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看你的计算机性能了,这是个超大体系,一般的算力应该模拟不了,用GPU加速我模拟过百万个原子体系的模型,不过也只是100纳米左右的体系,给你参考一下。

发自小木虫Android客户端
2楼2018-10-19 11:49:00
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果是三维体系,每个维度的长度都达到几微米,那是绝对不可行。大型的计算机可能可以模拟一亿个原子左右的体系,但那不是普通的计算机能玩的。如果你是用粗粒化模型,另当别论。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2018-10-19 14:43:08
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冀冀冀冀

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 梧桐77 at 2018-10-19 11:49:00
看你的计算机性能了,这是个超大体系,一般的算力应该模拟不了,用GPU加速我模拟过百万个原子体系的模型,不过也只是100纳米左右的体系,给你参考一下。

感谢回复,最近打算用多尺度方法模拟微切削过程,涉及到的MD区域至少在几微米,看来得想别的方法了。
4楼2018-10-19 14:49:32
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冀冀冀冀

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by brucefan at 2018-10-19 14:43:08
如果是三维体系,每个维度的长度都达到几微米,那是绝对不可行。大型的计算机可能可以模拟一亿个原子左右的体系,但那不是普通的计算机能玩的。如果你是用粗粒化模型,另当别论。
...

感谢回复,我去研究下粗粒化模型,看能否解决我所遇到的问题
5楼2018-10-19 14:51:41
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