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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 引物设计的问题
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沈药无涯

禁虫 (初入文坛)
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1楼2018-10-16 16:02:07
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wukangming

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你设计引物的那个基因可能会出现很多变体（NCBI） 但无论他们怎么变，他的保守区，即CCDS区都是不变的，因为那是蛋白编码序列，所以设计的引物最好在CCDS区，实在不行或没有变体的情况下就随意。

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静水流深
2楼2018-10-16 16:28:32
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海风_Spume

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你这个是什么引物，一般微生物是设计保守序列的。设计保守序列是因为要保证引物可以正常工作，如果在可变区域设计引物如果要尽可能保留多样性就需要设计更多的引物

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液相探针/多重引物设计，欢迎交流经验
3楼2018-10-16 16:58:29
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海风_Spume

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 海风_Spume at 2018-10-16 16:58:29
你这个是什么引物，一般微生物是设计保守序列的。设计保守序列是因为要保证引物可以正常工作，如果在可变区域设计引物如果要尽可能保留多样性就需要设计更多的引物
...

补充一点，举个例子设计人基因组引物的时候要避开SNP，因为SNP都变化可能造成引物不工作

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液相探针/多重引物设计，欢迎交流经验
4楼2018-10-16 17:01:53
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