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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
问题解决了，只说明一下刘老师给的试用版的例子，把单个文件夹（金刚石（100）拉伸为例）上传以后，把input.dat文件里面的mpirun 后面的vasp执行文件改成你编译的vasp执行文件名，其他的不用变，再输入chmod a+x strength.py转换为python执行文件，运行 ./stength.py，看到有vasp运行的log出来就可以了
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为何在雨伞外独行
11楼2018-10-06 10:39:37
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
用上面的方法提交的python只能在shell连接的情况下运行，用下面的方法提交python脚本可以实现linux 下后台运行python脚本，这样你的破机子就可以关着机运行脚本了（详情https://www.cnblogs.com/master-pokemon/p/5790783.html）

$ nohup python -u test.py > out.log 2>&1 &
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为何在雨伞外独行
12楼2018-10-19 23:02:40
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muanipo

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 眼泪和花生 at 2018-10-19 23:02:40
用上面的方法提交的python只能在shell连接的情况下运行，用下面的方法提交python脚本可以实现linux 下后台运行python脚本，这样你的破机子就可以关着机运行脚本了（详情https://www.cnblogs.com/master-pokemon/p/5 ...

您好，我按照您的方法运行strength.py,但还是只进行常规弛豫，再运行一次strength.py就生成了一系列以数字命名的文件夹，里面的POSCAR都是一样的，这个该怎么解决啊？
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13楼2018-10-29 17:44:36
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by muanipo at 2018-10-29 17:44:36
您好，我按照您的方法运行strength.py,但还是只进行常规弛豫，再运行一次strength.py就生成了一系列以数字命名的文件夹，里面的POSCAR都是一样的，这个该怎么解决啊？...

你的input.dat文件是不是没改？
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为何在雨伞外独行
14楼2018-11-01 12:49:55
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by muanipo at 2018-10-29 17:44:36
您好，我按照您的方法运行strength.py,但还是只进行常规弛豫，再运行一次strength.py就生成了一系列以数字命名的文件夹，里面的POSCAR都是一样的，这个该怎么解决啊？...

你的input.dat文件是不是没改？
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为何在雨伞外独行
15楼2018-11-01 19:47:40
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muanipo

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 眼泪和花生 at 2018-11-01 19:47:40
你的input.dat文件是不是没改？...

非常感谢能回复，我改了input.dat，前面的应变和角度都改了，最后一行换成提交任务到集群上的脚本的命令，结果就是常规弛豫，再运行一次就出现一系列POSCAR一模一样的文件夹
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16楼2018-11-02 17:56:24
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by muanipo at 2018-11-02 17:56:24
非常感谢能回复，我改了input.dat，前面的应变和角度都改了，最后一行换成提交任务到集群上的脚本的命令，结果就是常规弛豫，再运行一次就出现一系列POSCAR一模一样的文件夹...

你最后一行的vasp执行文件是你编译以后的那个文件吗？

发自小木虫Android客户端
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为何在雨伞外独行
17楼2018-11-04 19:47:26
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muanipo

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 眼泪和花生 at 2018-11-04 19:47:26
你最后一行的vasp执行文件是你编译以后的那个文件吗？
...

是的，先编译了vasp，vasp运行没有问题，的确可以只优化yz方向，修改input.dat，运行脚本结果就是之前的情况了。
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18楼2018-11-05 09:05:46
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a3302178

新虫 (初入文坛)
你好，能问一下怎么修改VASP编译才能用这个脚本吗？
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19楼2018-11-05 11:37:29
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by a3302178 at 2018-11-05 11:37:29
你好，能问一下怎么修改VASP编译才能用这个脚本吗？

https://sourceforge.net/p/ideal- ... ode/ci/master/tree/ 有中文教程
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为何在雨伞外独行
20楼2018-11-07 11:04:31
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