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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算理想强度将constr_cell_relax.F修改后怎么运行？
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)

[求助] 计算理想强度将constr_cell_relax.F修改后怎么运行？

我试着将文件constr_cell_relax.F修改了，vasp也重新编译了（make clean > make），上传Liuhanyu老师给的金刚石的案例，直接mpirun发现算的依然是常规的弛豫，将input.dat脚本chmod之后再运行也是算的常规的，请问这是什么原因？
另外，Liuhanyu老师给的金刚石例子里面有个strength.py文件，我chmod之后./就得到了几十个重复的文件夹，这个py具体怎么用？是在计算结果出来以后后处理用的吗？
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为何在雨伞外独行
1楼2018-10-03 10:17:44
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
没人么?
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为何在雨伞外独行
2楼2018-10-03 13:36:05
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mywai520 at 2018-10-03 13:57:23
在计算文件夹建立一个文件OPTCELL,在该文件中写入110，表示优化xy晶格，z固定不动

谢谢您，那提交任务的时候是会默认读取input.dat 吗？我采用的是直接 在constr_cell_relax.F的“REAL(q) FCELL(3,3)”下面的任意行加上FCELL(1,1)=0.0，
然后重新编译，mpirun提交的时候发现算的不是，这是什么原因呢？是我编译的有问题嘛？
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为何在雨伞外独行
4楼2018-10-03 15:04:28
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mywai520 at 2018-10-03 13:57:23
在计算文件夹建立一个文件OPTCELL,在该文件中写入110，表示优化xy晶格，z固定不动

我把input.dat chmod之后运行，读不到input前面的字符./input.dat: line 1: POSCAR: command not found
./input.dat: line 2: 0.01: command not found
./input.dat: line 3: 50: command not found
./input.dat: line 4: 0.0: command not found
./input.dat: line 5: 1: command not found
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为何在雨伞外独行
5楼2018-10-03 15:45:41
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
6楼2018-10-03 20:09:38
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by fuyouzhuo85 at 2018-10-03 20:37:15
好

。。。
8楼2018-10-04 09:31:27
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by surelv at 2018-10-04 09:38:14

各位大哥能不水了吗
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为何在雨伞外独行
10楼2018-10-04 09:38:53
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
问题解决了，只说明一下刘老师给的试用版的例子，把单个文件夹（金刚石（100）拉伸为例）上传以后，把input.dat文件里面的mpirun 后面的vasp执行文件改成你编译的vasp执行文件名，其他的不用变，再输入chmod a+x strength.py转换为python执行文件，运行 ./stength.py，看到有vasp运行的log出来就可以了
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为何在雨伞外独行
11楼2018-10-06 10:39:37
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
用上面的方法提交的python只能在shell连接的情况下运行，用下面的方法提交python脚本可以实现linux 下后台运行python脚本，这样你的破机子就可以关着机运行脚本了（详情https://www.cnblogs.com/master-pokemon/p/5790783.html）

$ nohup python -u test.py > out.log 2>&1 &
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为何在雨伞外独行
12楼2018-10-19 23:02:40
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眼泪和花生

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by muanipo at 2018-10-29 17:44:36
您好，我按照您的方法运行strength.py,但还是只进行常规弛豫，再运行一次strength.py就生成了一系列以数字命名的文件夹，里面的POSCAR都是一样的，这个该怎么解决啊？...

你的input.dat文件是不是没改？
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为何在雨伞外独行
14楼2018-11-01 12:49:55
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