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melodyxin

铜虫 (小有名气)

[交流] 我的序列分析,关于稀有密码子的,麻烦大家帮忙看看!!

总长是1284

Amino Acid Rare Codon Frequency of Occurrence
Arginine CGA 4
CGG 1
AGG 14
AGA 16
Glycine GGA 7
GGG 7
Isoleucine AUA 0
Leucine CUA 5
Proline CCC 14
Threonine ACG 27

Repeated and/or Consecutive Rare Codons

CUA CGA = 1

CGA CCC = 2

CUA CUA = 1

GGG CUA = 1

ACG CCC = 3

ACG AGG = 1

ACG AGA = 3

AGA AGG = 1

ACG ACG = 2

GGA ACG = 1

AGG AGG = 1

AGA AGA = 2

CCC AGG = 1


这么多稀有密码子,心里好担心呐,是不是应该采用Rosetta菌株才行了啊??
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

不一定。
2楼2009-04-08 17:01:50
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jqq1985

银虫 (正式写手)

一般不是连续的稀有密码子的话,对表达影响不是太大
3楼2009-04-08 18:42:49
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