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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】IRC结果求助

----------------------------------------------------------------------
                  Summary of reaction path following:
                 (Int. Coord:  Angstroms, and Degrees)
                  Energy reported as Energy +  1211 a.u.
----------------------------------------------------------------------
                        ENERGY   RX.COORD     X1        Y1        Z1
           1           -0.80555  -0.24987  -1.10641   3.61069   1.19276
           2           -0.80555  -0.23673  -1.10568   3.61028   1.19200
           3           -0.80555  -0.22071  -1.10715   3.61072   1.19224
           4           -0.80555  -0.18292  -1.10562   3.61014   1.19226
           5           -0.80555  -0.09913  -1.10600   3.61050   1.19062
           6           -0.80554   0.00000  -1.09552   3.60088   1.19049
           7           -0.80554   0.09700  -1.08873   3.59367   1.19346
。。。

输入文件:
%chk=TS-1-freq.chk
# b3lyp/genecp irc=(rcfc,maxpoints=30) pop=full

TS-1-freq

0 2
H                 -1.09551700    3.60087700    1.19048700
S                 -1.04008600    3.31753900   -0.12768200
Au                -2.17528900    1.23036000   -0.02538600
Au                -3.16577400   -1.25117900    0.04827800
Au                 0.92261900    1.97495100   -0.03296700
Au                -0.45161500   -1.03447700    0.00808100
Au                 3.08409800    0.43436000    0.08903700
Au                 2.01047800   -2.07150300   -0.07625300

H S 0
6-311+g(3df)
****
Au 0
lanl2dz
****

Au 0
lanl2dz


输入文件要求30个点  结果只有几个,我想要更多的点,是不是需要减小步长? stepsize=多少合适呢?  谢谢!

[ Last edited by nyzhaoyin on 2009-4-8 at 19:55 ]
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sshadow

铁虫 (初入文坛)

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-9 07:51
应该不是步长的问题  我是这样写的
#RB3LYP/6-31++G(d,p) IRC=(CalcFC,maxpoint=30) test
就得到了30点的
2楼2009-04-08 16:20:02
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

我感觉找到的过渡态有问题

结构1,au6SH-15.jpg:-1211.801174
结构2,au6SH-3.jpg:-1211.798656
过渡态,TS-1.jpg:-1211.793366

做irc,结果如下:
----------------------------------------------------------------------
                  Summary of reaction path following:
                 (Int. Coord:  Angstroms, and Degrees)
                  Energy reported as Energy +  1211 a.u.
----------------------------------------------------------------------
                        ENERGY   RX.COORD     X1        Y1        Z1
           1           -0.80555  -0.24987  -1.10641   3.61069   1.19276
           2           -0.80555  -0.23673  -1.10568   3.61028   1.19200
           3           -0.80555  -0.22071  -1.10715   3.61072   1.19224
           4           -0.80555  -0.18292  -1.10562   3.61014   1.19226
           5           -0.80555  -0.09913  -1.10600   3.61050   1.19062
           6           -0.80554   0.00000  -1.09552   3.60088   1.19049
           7           -0.80554   0.09700  -1.08873   3.59367   1.19346

[ Last edited by nyzhaoyin on 2009-4-8 at 20:12 ]
3楼2009-04-08 20:09:52
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 4-9 07:52
也有可能是还没有到你设定的步长,它已经默认找到了。
4楼2009-04-08 20:34:06
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houwenjie

铁虫 (初入文坛)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-20 18:34
用stepsize=5试试,我都这么大
5楼2009-04-11 16:41:25
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qinhuaier

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
qi请教LZ,你传上的结构图是怎么传的?可以教一下我吗?谢谢你
6楼2009-07-17 17:37:21
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