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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】过渡态跑IRC后找定点的问题(放弃求助)
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】过渡态跑IRC后找定点的问题(放弃求助)

过渡态，计算以后，频率计算和IRC计算都正确，IRC结果如下，取出point1和point13结构进行优化，期望得到过渡态两头连接的定点。优化后发现得到同一个结果，请问这是怎么回事？
IRC计算设置： # IRC=(calcfc) b3lyp/6-31+g(d) geom=allcheck guess=read
定点优化命令设置： # opt=calcfc freq=noraman rB3LYP/6-31+g(d) geom=connectivity

还有就是在定点的结构中，应该有水分子生成，也就是说24号原子（H）应该和34号原子（O）成键，但是在图式的结果中，确不是这样，多次优化这个结构都得到这样的结果，频率计算没有虚频，证明这个结构是稳定的。请问这是怎么回事？

比较着急，请高手答疑。

[ Last edited by majun04 on 2009-4-10 at 08:38 ]
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1楼 2009-04-07 23:40:46
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢提醒 4-8 21:50
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-20 18:50
请先解释：右下的碳酸酯有什么用？反应中似乎其不参与。
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2楼2009-04-08 08:49:51
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
引用回帖:
Originally posted by cysqxr at 2009-4-8 08:49:
请先解释：右下的碳酸酯有什么用？反应中似乎其不参与。

碳酸酯是我的反应产物，这个点是最后一个过渡态，跑IRC找到点以后优化出来的，产物应该是碳酸酯和水。
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3楼2009-04-08 09:06:15
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-20 18:50
反应比较复杂了点
你先介绍一下啊，没怎么看懂。
初步怀疑你的过渡态没计算对。
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4楼2009-04-09 11:17:15
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
引用回帖:
Originally posted by cysqxr at 2009-4-9 11:17:
反应比较复杂了点
你先介绍一下啊，没怎么看懂。
初步怀疑你的过渡态没计算对。

我这个是多步反应中得最后一步，过渡态得振动频率是正确得，对应成键和断键得伸缩振动。
我现在就是不明白除了碳酸酯以外的那部分是怎么存在的。
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5楼2009-04-09 11:37:37
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-20 18:50
为什么不去掉碳酸酯呢？剩下的那部分就是个质子转移过程。
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6楼2009-04-09 16:32:38
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
引用回帖:
Originally posted by cysqxr at 2009-4-9 16:32:
为什么不去掉碳酸酯呢？剩下的那部分就是个质子转移过程。

能不能一步就有水生成？我得另外得一条路径，就是直接生成水，碳酸酯和TBD，这个是并行得另外得一条路线。
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7楼2009-04-09 20:22:18
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