24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3279  |  回复: 31
【奖励】 本帖被评价12次,作者zhaolixia0814增加金币 8.75
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhaolixia0814

金虫 (小有名气)


[资源] [原创] 半年载体构建中连接的心得, 欢迎大家一起切磋交流

去年做了半年载体构建,连接无疑是其中重要的一关,根据自己的实验心得和已有资料做个总结,希望对大家有用,同时希望战友们批评指正!互相进步!
首先说说2片段连接
通常是指目的片断和载体片断的连接,包括①小片段(目的片断小于载体片断的大小)和载体片段的连接,这种情况多些,也比较容易连接,按照说明书要求的比例进行即可,比如TAKARA的pMD19-T Simple Vector连接时Vector DNA和Insert DNA的摩尔比一般为1 :2~10即可,如果效果不佳,检测一下感受态细胞,如果片断过小比如几十bp,连接时要加大小片段的摩尔数,多连几管,挑选白斑,以上是指双酶切后的连接,即载体和目的片断俩端的酶切位点相同;②大片段(目的片断与载体片断的大小差不多甚至大于载体的大小)和载体片段的连接,目的片断与载体片断的大小差不多的情况应尽量避免,因为这会给目的片断胶回收带来麻烦,我就遇到过这种情况,胶回收时很是费尽,最后勉强分开,当然换个载体也许就解决问题了。我做过3000多bp和pMD19-T Simple Vector的连接,开始不行,后来成功了,连接率不高,我的经验是如果感受态细胞没问题,那就反复试目的片断和载体片断的连接比例,可以超出此范围1 :2~10一试。



再说说多片断的连接
做多个片断的连接,首先强调一个问题,那就是大家一定要注意所有片断俩端的酶,把他们的特征要弄得清清楚楚,是否存在同尾酶和同裂酶,多片段同时连接时这个问题就太重要了;多片段连接要总体先规划好了,再开始入手设计引物,否则考虑不周后患无穷啊,呵呵!
①多片断的连接最经常的做法是顺次俩俩连接(目的片断和载体片断的连接),就采用载体上的多克隆位点,注意顺序!如果所选载体多克隆位点上的俩个酶切位点比较近,甚至相邻,最好分步酶切载体,比双酶切效果好的多,经验!接下来的方法和前面的差不多,就是麻烦些
②多片断的同时连接,我最多做过四个片断的同时的连接,当然,其中包括载体片断。做多个片断的同时连接,不得不把我走过的弯路告诉大家!那就是同尾酶的问题,我也是在合成引物后发现的这个问题,我的其中一个片断俩端分别是XhoI和SalI,结果问题来了,酶切后连接时有可能正连也可能反向连接,如果连正了还好,反了就比较郁闷了,根据当时的实验设计,如果想改就得改所有其他片段的引物,硬着头皮来吧!筛吧!一个原则,小片段要量大,多设计几种比例,连吧,挑选白斑,做菌落PCR检测连接情况,想想觉得痛苦,每个板挑几十个白斑做鉴定,大部分假阳性,不过最后还是找到了正确连接的克隆,可是浪费了很多时间和金钱,惨痛的教训!感觉多片断的连接,关键还是片断之间的摩尔比,大胆尝试吧!


需要说明的一点,以上主要是针对粘性末端的连接,关于平端连接,我做的比较少,欢迎其他同学总结!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by 水过无恒 at 2009-7-19 10:31:
怎么都是酶切连接啊,我们实验室都用无酶克隆的,2000以下的都是小case,缺点就是感受态的效率要高,10 的9此方以上。
还可以用LIC克隆,PIPE克隆啊,效率都很高的

能不用任何酶就能把克隆做出来的?你说的无酶是指不用连接酶的意思吧,如果真能无酶克隆,希望楼主把方法传授给大家哦
27楼2009-10-13 17:05:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

★★★ 三星级,支持鼓励


amisking(金币+1,VIP+0): 10-13 21:24
QIAGEN核酸纯化、回收试剂盒 + Invitrogen以上级别的DNA聚合酶扩增 + NEB工具酶 = 100%成功率……目前未尝败绩~~~

如果选择T载体,可以选promega的~~
2楼2009-04-06 22:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anlewo7777

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢分享,你们做实验时对扩增序列的保真问题有什么好的措施没有?
3楼2009-04-07 08:37:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猫三两只

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐


350784478(金币+1):谢谢
不错,谈谈我的问题,我的片段是1500-1800左右,应该不算大,要连到一个将近7000的载体上,连了很长时间都没连上,感受态细胞应该没有问题,因为我是先将PCR产物连到T载体上的,而且一连就连上了,每次挑3-4个菌斑,都是阳性克隆
4楼2009-04-07 12:10:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +25 hualkop 2026-04-12 27/1350 2026-04-19 01:58 by 烟雨流涯
[考研] 生物学调剂 +10 纸扇zhishan 2026-04-13 10/500 2026-04-18 21:19 by zqndavala
[考研] 320求调剂 +5 深郊akm 2026-04-17 5/250 2026-04-18 19:52 by 王珺璞
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +33 yzyzx 2026-04-12 37/1850 2026-04-17 23:00 by wunaiy88
[考研] 294求调剂 +7 淡然654321 2026-04-17 8/400 2026-04-17 16:36 by wutongshun
[考研] 294求调剂 +14 淡然654321 2026-04-15 14/700 2026-04-16 21:01 by lpl364211
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 105500药学求调剂 +4 x_skys 2026-04-12 4/200 2026-04-14 13:37 by rndfc
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +11 不会吃肉 2026-04-12 11/550 2026-04-13 21:59 by bljnqdcc
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
信息提示
请填处理意见