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木虫 (正式写手)

[交流] 关于蛋白质结构预测

我的样品是Gly-Pro-Pro重复的18肽，想做个结构预测，可尝试了很多次总是得不到结果，我觉得是自己对蛋白结构预测的领域不是很了解的原因。我应该怎样去做才能得到这个18肽预期的结果，迫切希望对这方面比较懂的高手帮帮忙

1楼 2009-04-06 14:51:36

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有没有利用蒙特卡罗模拟退火做的软件？

4楼2009-06-02 20:46:07

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新虫 (初入文坛)

★ ★
0202liuyan(金币+2,VIP+0):谢谢你，可是我也是用的同源建模，可做不出结果，麻烦您能再说详细些吗？ 4-7 13:40

你是用过同源结构预测了吗？如果有已知结构的相似序列，那么采用同源结构预测可以得到精确度比较高的结构，方法很多，可以用MODELLER,或者网上的服务器。如果没有只能采用从头预测的方法了，那么精确度就不乐观了。

2楼2009-04-06 21:38:49

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新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
0202liuyan(金币+3,VIP+0):多谢帮忙，我现在还是做不出来，再熟悉熟悉，呵呵 4-14 10:57

做不出结果？你能搜索到已知结构的同源序列吗？如果能的话，一般都会有结果的。相关的免费服务，你可以参看http://hpdb.hbu.cn/thesis/2005/general2.asp的介绍。河北大学的服务器好像也可以提供服务http://protein.hbu.cn/index.html。

3楼2009-04-08 22:00:03

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