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【讨论】利用分子动力学模拟机器配置?
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请问第一性原理来模拟,机器配置最低要求? 通常除了并行外,最少需要的机器数量. 谢谢 |
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2楼2009-04-06 11:11:09
bay__gulf
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4楼2009-04-07 10:49:32
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bay__gulf
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qasd(金币+3,VIP+0):xiexie 4-8 20:08
qasd(金币+3,VIP+0):xiexie 4-8 20:08
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量化计算内存是很重要的，内存低了不是算得快慢的问题，而是能不能算的问题。 推荐为每个CPU配有2G内存。cpu能多就多。 而如果只是md模拟，cpu的频率和个数是绝对因素。内存无所谓，namd的 “memory usage for a 100,000 atom system with a 12A cutoff can approach 300MB”，不过现在内存还没有大白菜贵，多加些也无所谓。 不明白你说“通常除了并行外,最少需要的机器数量.”什么意思，在一台机器上总是能算，并行会更快些，但能快多少得看软件的并行能量和节点间通信速度。 如果要并行，网络要好，1gbps是最低要求。 [ Last edited by bay__gulf on 2009-4-7 at 19:33 ] |
6楼2009-04-07 19:29:19
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7楼2009-04-08 08:31:12
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