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杨洁29

新虫 (小有名气)

[求助] 有人做CHIP吗求助求助已有1人参与

最近遇到瓶颈期了,急求大神相助

发自小木虫Android客户端
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2楼2018-08-27 12:58:58
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刺客玩家

铜虫 (小有名气)

什么问题?我做过酵母里面的

发自小木虫Android客户端
人生最后悔的事不在于失败,而在于从未尝试。
3楼2018-08-27 13:22:10
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jinkairui123

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
什么问题直接说呗!
武汉金开瑞生物,提供核酸和蛋白的整体研究方案
4楼2018-08-29 15:31:58
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杨洁29

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jinkairui123 at 2018-08-29 15:31:58
什么问题直接说呗!

是这样的,最近我一直在做chip—seq,但是饭最后一步的时候就是没有DNA沉淀下来,因为是用植物细胞做的,没有找到已经成熟的实验体系,因此求助

发自小木虫Android客户端
5楼2018-08-30 18:34:55
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刺客玩家

铜虫 (小有名气)

人生最后悔的事不在于失败,而在于从未尝试。
6楼2018-12-26 10:29:41
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atikou

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 杨洁29 at 2018-08-30 18:34:55
是这样的,最近我一直在做chip—seq,但是饭最后一步的时候就是没有DNA沉淀下来,因为是用植物细胞做的,没有找到已经成熟的实验体系,因此求助
...

首先,你做植物的chip,第一步交联的时候的处理非常的重要,特别是如果你做转录因子的时候。你交联的时候,要保证交联的环境是处于真空状态,这样才能使甲醛溶液进去细胞壁,从而达到固定作用。在真空固定以后,通过PBS洗涤后,吸水纸吸干,液氮冻存。实验时液氮研磨,在裂解,打断。然后通过抗体富集以后,通过不同的洗脱buffer洗脱。这个洗脱buffer也挺重要的,能不能洗干净杂质就是这里,然后解交联后,DNA沉淀,建库。
-------------来自易基因的回答
7楼2021-09-01 12:55:28
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