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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 免疫实验 » 有人做CHIP吗求助求助
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杨洁29

新虫 (小有名气)

[求助] 有人做CHIP吗求助求助 已有1人参与

最近遇到瓶颈期了，急求大神相助

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1楼 2018-08-27 12:43:30
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jiangdaohang


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2楼2018-08-27 12:58:58
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刺客玩家

铜虫 (小有名气)
什么问题？我做过酵母里面的

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人生最后悔的事不在于失败，而在于从未尝试。
3楼2018-08-27 13:22:10
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jinkairui123

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
什么问题直接说呗！
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武汉金开瑞生物，提供核酸和蛋白的整体研究方案
4楼2018-08-29 15:31:58
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杨洁29

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jinkairui123 at 2018-08-29 15:31:58
什么问题直接说呗！

是这样的，最近我一直在做chip—seq，但是饭最后一步的时候就是没有DNA沉淀下来，因为是用植物细胞做的，没有找到已经成熟的实验体系，因此求助

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5楼2018-08-30 18:34:55
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刺客玩家

铜虫 (小有名气)
YQ195316

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人生最后悔的事不在于失败，而在于从未尝试。
6楼2018-12-26 10:29:41
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atikou

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 杨洁29 at 2018-08-30 18:34:55
是这样的，最近我一直在做chip—seq，但是饭最后一步的时候就是没有DNA沉淀下来，因为是用植物细胞做的，没有找到已经成熟的实验体系，因此求助
...

首先，你做植物的chip，第一步交联的时候的处理非常的重要，特别是如果你做转录因子的时候。你交联的时候，要保证交联的环境是处于真空状态，这样才能使甲醛溶液进去细胞壁，从而达到固定作用。在真空固定以后，通过PBS洗涤后，吸水纸吸干，液氮冻存。实验时液氮研磨，在裂解，打断。然后通过抗体富集以后，通过不同的洗脱buffer洗脱。这个洗脱buffer也挺重要的，能不能洗干净杂质就是这里，然后解交联后，DNA沉淀，建库。
-------------来自易基因的回答
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7楼2021-09-01 12:55:28
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