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lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

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[交流] ChIP-seq能研究哪些蛋白，只有转录因子吗？

我想问一下大家，Chip-seq能研究和转录因子互作的蛋白的DNA结合位点吗吗？比如说，有一个蛋白可以和若干转录因子互作，我给这个蛋白加上了标签，想用Chip-seq看一下和他互作的若干个转录因子都有哪些结合位点，这样可以吗？

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1楼 2018-08-26 00:00:58

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atikou

铜虫 (小有名气)

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注册: 2020-06-10
专业: 基因表达调控与表观遗传学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

不行吧，首先，我们再富集之前会将样本进行超声波打断，然后再通过抗体富集。你只给了蛋白加上了标签，就说明抗体富集的就只有这个蛋白，那些和蛋白相互作用的转录因子的位点是否和打断后蛋白处于一条链中都是未知数，也就是说我们不能保证我们富集下来的DNA里面有其他转录因子的结合位点的DNA。这就增加了数据的不可靠性。
--------------来着深圳易基因的回答

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2楼2021-09-05 22:49:21

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