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【求助】请大家帮我看看Discover Dynamics的结果，谢谢！
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Dynamics Summary ________________ Initial Final Average Std. Dev. ------- ----- ------- --------- Tot. energy (kcal/mol) 871.594 1400.501 1386.528 62.563 Pot. energy (kcal/mol) -307.191 543.527 538.095 42.428 Kin. energy (kcal/mol) 1178.785 856.975 848.432 34.503 Temperature (K) 423.150 307.629 304.563 12.386 Pressure (GPa) -0.079232 -0.045040 -0.036764 0.005308 Volume (A^3) 102580.129 102580.129 102580.129 0.169 Density (gm/cm^3) 0.1120 0.1120 0.1120 0.0000 用的NVT系综，为什么压强是负的呀？ [ Last edited by 200702010 on 2009-4-3 at 10:06 ] |
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2楼2009-04-03 09:23:02
3楼2009-04-03 09:27:37
wendaoliuxu
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4楼2009-04-03 09:27:42
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wendaoliuxu
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未平衡？
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qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 4-19 12:17
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 4-19 12:17
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先画了一个甲醇分子，用Discover 优化（方法smart minimizer） 然后用Amophous Cell Constuction建立一个216个原子的盒子 用Amophous Cell 优化（Newton）都是用的Ultra-fine 然后做的Discover Dynamics NVT，即表示具有确定的粒子数（N）、体积（V）、温度（T） 可能未达平衡状态，为保证温度的恒定，压强为负； 且NVT达平衡体系才算为封闭体系，未平衡时，压强是不准确的，可能出现负值； 可参考蒙特卡罗方法相关经典书籍。 |
9楼2009-04-19 10:20:52