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railic

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】优化时怎么能让一个变量在固定范围内变化?谢~~

小弟比较菜,在做一个分子的优化,只希望获得反式的最优结构,需要二面角(例如D7(1,8,9,10))在优化中只在90-180度之间变化。不知怎么用Gaussian表达?

谢谢大虾们啦~~
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niliu

铁杆木虫 (著名写手)


jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论 4-3 21:04
scan
2楼2009-04-03 07:38:39
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railic

新虫 (初入文坛)

但是scan只能获得几个点的能量值,然后找个相对最低值,并不能获得准确的90-180度间的最优结构啊....
3楼2009-04-03 12:31:58
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cysqxr

木虫 (小有名气)


jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论 4-3 21:04
使用  scan和opt的联用吧
4楼2009-04-03 16:54:49
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railic

新虫 (初入文坛)

scan + opt 意思是二面角去scan一系列固定的角度值,其他所有参数自由变化对应的一系列最优吧?
我的意思是二面角也可以自由变化,和其他所有参数的区别是它只能在钝角范围内自由变化,好像稍微有点区别,这样应该如何?
anyway,谢谢了
5楼2009-04-03 22:35:03
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sizj

金虫 (正式写手)


★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-8 09:09
我正在算一个类似的工作
命令行加opt=modredundant  nosymm
。。。
。。。
。。。
内坐标后空一行后加上:
* b c * R
a b c d s 步数 步长

手册P131
6楼2009-04-04 12:22:08
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cysqxr

木虫 (小有名气)

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-8 09:09
因为你做的是部分优化,用scan和opt 联用做出的势能面(步长小一些),可以说明你的问题的话,就可以了,毕竟是模拟。如果体系比较特别的话,可以考虑加对称性来限制你的参数。如果想做的是一个稳定构象的话,你必须确保它的存在性,不然会白做功哦。
7楼2009-04-06 10:26:30
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railic

新虫 (初入文坛)

唔....大侠说得有理,不过这个分子比较大,若是用比较小的步长来scan,可能会作比较多的无用功.....
还是谢谢啦~~!
8楼2009-04-06 12:09:59
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