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分子动力学的基本原理 已有2人参与
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分子动理论是通过牛顿力学、流体力学等把微观分子运动和宏观的压力等物理量联系起来，容易理解。 但是分子动力学，和分子动理论差太多了，无法理解，谁能通俗解释下？或者通俗QM/MM的原理。谢谢 |
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焦虑
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dingweilu
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小红豆: 金币+5, 回答帖子 2018-08-18 00:18:16
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qmmm是重要的部分用量子力学处理，周围的影响不大的用分子力学处理 发自小木虫Android客户端 |
2楼2018-08-17 07:17:07
liukexin1004
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3楼2018-08-17 10:35:03
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小红豆: 金币+20, 回答帖子 2018-08-18 00:18:41
小红豆: 金币+20, 回答帖子 2018-08-18 00:18:41
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QM/MM的原理是什么？ 1） 分子力学也叫力场方法，基本原理还是最小作用量原理，在分子内部化学键都有“自然”的键长值和键角值。分子要调整它的几何形状(构象)，以使其键长值和键角值尽可能接近自然值,同时也使非键作用处于最小的状态。换言之，分子内部的空间作用是众所周知的,基团或原子之间靠近时则相互排斥,o为了减少这种作用,基团或原子就趋于相互离开,但是这将使键长伸长或键角发生弯曲,又引起了相应的能量升高。最后的构型将是这两种力折衷的结果,并且是能量最低的构型”； 2） 分子力学是经验的计算，分子体系的能量，即空间能Es=Ec+Et+Eb+Enb， Ec是键的伸缩能(Compresion Energy),Eb是键角弯曲能(Bending Energy),Et是键的二面角扭转能(Torsiona lEnergy),Enb是非键作用能(NonbondedEnergy),它包括VanderWaals作用能,偶极(电荷)作用能、氢键作用能等等； 3） 这种位能函数描述了各种、形式的相互作用力对分子位能的影响,它的有关参数、常数和表达式通常称为力场。式(1)中的E,对于某个分子来说,是它的构象的函数。由于在分子内部的作用力比较复杂,作用类型也较多;对于不同类型的体系作用力的情况也有差别； 4） 而Ec+Et+Eb+Enb这些数据，可以通过量子力学计算得出；所以QM/MM开始称为一个重要的方向； 5） 归纳起来就是，Qmmm的原始数据（重要的部分）用量子力学处理，周围的影响不大的（非重要部分）用分子力学处理。量子力学部分是第一性的，分子力学是经验的； 抛砖引玉，请各位老铁多多指教。 |
4楼2018-08-17 23:15:48
