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alman001

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何鉴定uncharacterized protein的功能?

我通过转录组测序得到了一个逆境胁迫差异表达基因(植物),已经扩增得到编码序列,在NCBI上blast后也有同源度很高的其他物种序列,但是都注释为uncharacterized protein,这样的基因能算作新基因(novel gene)吗?该怎么研究它的功能并命名呢?

求各位同行指点,多谢了!
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有事做,无事争
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867575969

至尊木虫 (著名写手)

One Piece

可以试试转到拟兰介其他模式植物里看看有什么变化没

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有些东西因为得不到而变得美好,有些东西因为拥有而变得弥足珍贵!
2楼2018-08-17 15:45:49
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alman001

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 867575969 at 2018-08-17 15:45:49
可以试试转到拟兰介其他模式植物里看看有什么变化没

嗯,可以试试,谢谢!
有事做,无事争
3楼2018-08-20 11:12:49
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867575969

至尊木虫 (著名写手)

One Piece

引用回帖:
3楼: Originally posted by alman001 at 2018-08-20 11:12:49
嗯,可以试试,谢谢!...

如果后期转进去后可能看不到表型明显变化的话,可以在转录水平上测定其表达量,关联互作蛋白,建立蛋白互作机制图谱,确定其生理意义,另外还可以提取其表达蛋白研究其空间物理结构,推导其作用

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有些东西因为得不到而变得美好,有些东西因为拥有而变得弥足珍贵!
4楼2018-08-24 17:57:17
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xqgeng

新虫 (小有名气)

5楼2018-08-24 18:14:20
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xqgeng

新虫 (小有名气)

你首先找个软件看看可能的蛋白结构,根据其结构域尤其是保守的motif,推测其功能,然后进一步鉴定。

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6楼2018-08-24 18:15:32
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