[求助] 希望大佬们帮忙看一下这个invalid atom type in fix shake报错是为什么啊？ 已有1人参与

在data文件中mass已经都定义出来了原子类型了：     804 atoms     734 bonds    1144 angles    1626 dihedrals     120 impropers   10 atom types   12 bond types   24 angle types   31 dihedral types    3 improper types     -0.063168202    29.936831798 xlo xhi     -1.070661042    28.929338958 ylo yhi     -0.531017684    29.468982316 zlo zhi Masses    1  15.999400 # o*    2   1.007970 # h*    3   1.007970 # h    4  12.011150 # c2    5  12.011150 # c'    6  15.999400 # o'    7  14.006700 # n2    8   1.007970 # hn    9  12.011150 # c1   10  12.011150 # c3 但是in文件中group了水分子也就是type 1 2，为什么fix shake报错？ units           real atom_style      full boundary p p p #kspace_style    pppm  1e-4          #Out of range , can't compute PPPM kspace_style     ewald 1e-4          ########################################### pair_style lj/cut/coul/long 10.0 10.0 pair_modify     mix arithmetic ########################################### bond_style      harmonic angle_style     harmonic dihedral_style  harmonic improper_style  cvff read_data       PAM.test             thermo_style    custom step fmax fnorm pe evdwl emol ecoul epair ebond eangle edihed elong thermo 100 group           water     type 1 2 group           poly      type 3 4 5 6 7 8 9 10 neighbor        2.0 bin neigh_modify    delay 0 every 1 check yes timestep        0.5          #1.0 min_style sd min_modify dmax 0.2 minimize 1.0e-5 1.0e-6 2000 10000 reset_timestep 0 compute mol poly chunk/atom molecule compute 1   poly com/chunk mol compute 2   poly gyration/chunk mol compute 3   poly msd/chunk mol   fix     ave1  poly ave/time 1 100 1000  c_1[1] c_1[2] c_1[3] c_2  c_3[1] c_3[2]  c_3[3] c_3[4] file msdandgyra.data  mode vector fix 1 all nve fix 2 all temp/berendsen 300.0 300.0 10.0   fix 3 water  shake  0.0001 20 1000 t 12 报错是这样的： ERROR: Invalid atom type index for fix shake (../fix_shake.cpp:144) Last command: fix 3 water  shake  0.0001 20 1000 t 12 求大佬帮忙看一下

回复此楼

» 猜你喜欢

• 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 已经有4人回复
• 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 已经有4人回复
• 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 已经有4人回复
• 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 已经有4人回复
• 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 已经有3人回复
• 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 已经有3人回复
• 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 已经有3人回复
• 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 已经有4人回复
• 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 已经有3人回复
• 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 已经有3人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)