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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Forcite动力学后模型严重变形
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pumf

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Forcite动力学后模型严重变形

本人用Forcite对蒙脱石做了动力学模拟，条件是“温度T=300 K, 压力p=105 Pa,
时间步长0.5 fs, 模拟时间600 ps, 温度控制方法选择Nose-Hoover, 压力控制方法选择Berendsen,”，但是做完后发现模型严重变形，而且完全超出正常范围。请教各位高手是什么问题。

[ Last edited by aylayl08 on 2010-3-23 at 08:17 ]
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1楼 2009-04-01 20:19:32
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qasd

木虫 (著名写手)
★
wuchenwf(金币+1):谢谢
做的吸附？基质固定
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2楼2009-04-01 22:15:05
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pumf

木虫 (正式写手)
恩，是吸附。需要基质固定啊？那还怎么表征表面和被吸附物的作用呢？
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3楼2009-04-01 22:57:06
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qasd

木虫 (著名写手)
★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 4-2 23:48
算吸附能的话需要固定
如果有其他相互作用也只需要放开表层，而且要先动力学平衡一段，再逐步放开
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4楼2009-04-01 23:00:57
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pumf

木虫 (正式写手)
恩，好的哦。多谢版主了。
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5楼2009-04-02 20:20:21
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imation

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢交流，欢迎常来 4-3 21:56
NPT系综确实有这个问题，另外，这个不是NVT，而是NPT，volume在pressure作用下是有变化的，只是有时候觉得那个变形很不规律，也许是参数设置的问题，比如压力方法里面的参数，温度控制的参数等，绝对是有影响的，默认的不是对所以体系都适用
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6楼2009-04-03 09:11:46
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pumf

木虫 (正式写手)
恩，谢谢您。
我用NVT和NVE的时候不会出现这种问题。在用NPT的时候，温度控制是Nose，压力控制是Berendsen。今天我把温度和压力的控制方法都换了，换成Anderson，但是问题还是存在。
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7楼2009-04-03 13:44:23
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