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SHISHULI

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR 已有1人参与

有谁知道荧光定量PCR是怎么测出SNP的

@gyesang 发自小木虫IOS客户端
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1楼 2018-07-16 15:41:50
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ghst110

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
SNP检测所用qPCR是Taqman探针法
简单来说，就是设计MBG探针两条，比如一条Fam，另一条ViC。这两条引物结合位点包含错配的话，就结合不牢，反之结合牢固。
Taqman的原理就是利用Taq 的5-3外切酶活性，切割探针，这样结合牢固的探针会被切，激发荧光，含有错配mismatch位点，则相应的探针结合不牢，，也就较少的被切(低效切割）。
这样根据荧光信号增加量是纯fam ，或纯Vic,SNP类型就是X:X,Y:Y纯合型。如果是fam,Vic都有，则是X:Y。
希望对你理解这种SNP分型有帮助。
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*才随遇长，识以穷精*
2楼2018-07-16 17:10:09
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SHISHULI

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ghst110 at 2018-07-16 17:10:09
SNP检测所用qPCR是Taqman探针法
简单来说，就是设计MBG探针两条，比如一条Fam，另一条ViC。这两条引物结合位点包含错配的话，就结合不牢，反之结合牢固。
Taqman的原理就是利用Taq 的5-3外切酶活性，切割探针，这 ...

谢谢

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3楼2018-07-17 08:38:02
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