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mochenmi

铜虫 (小有名气)

[求助] 热图制作

之前做过RNA-seq的热图绘制,使用的是FPKM值,然后标准化。
现在有一批荧光定量PCR的试验结果,想绘制成热图。根据2-△△Ct方法计算出了表达量,下调的数值为0-1之间,上调的大于1。
我想反应出上调的为红色,下调的为绿色,但是直接Z-Score标准化后,有一些上调倍数不高的会变成负数。应该如何标准化?
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宋小吉

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dadd饭团 at 2018-08-22 14:48:32
同学,你好。我用荧光定量pcr 测出基因表达量后
发现其water空白组的表达量很高,想问下这可能是什么原因呢?

你好,我想问一下,如果我是不同时间的测出来的结果,有相同也有不同的物质如何进行Z-scort的,刚接触这个归一方法,谢谢
3楼2020-11-29 19:24:50
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dadd饭团

新虫 (初入文坛)

同学,你好。我用荧光定量pcr 测出基因表达量后
发现其water空白组的表达量很高,想问下这可能是什么原因呢?
2楼2018-08-22 14:48:32
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