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mochenmi

铜虫 (小有名气)

[求助] 热图制作

之前做过RNA-seq的热图绘制，使用的是FPKM值，然后标准化。
现在有一批荧光定量PCR的试验结果，想绘制成热图。根据2-△△Ct方法计算出了表达量，下调的数值为0-1之间，上调的大于1。
我想反应出上调的为红色，下调的为绿色，但是直接Z-Score标准化后，有一些上调倍数不高的会变成负数。应该如何标准化？
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1楼 2018-07-11 15:54:20
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宋小吉

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dadd饭团 at 2018-08-22 14:48:32
同学，你好。我用荧光定量pcr 测出基因表达量后
发现其water空白组的表达量很高，想问下这可能是什么原因呢？

你好，我想问一下，如果我是不同时间的测出来的结果，有相同也有不同的物质如何进行Z-scort的，刚接触这个归一方法，谢谢
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3楼2020-11-29 19:24:50
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dadd饭团

新虫 (初入文坛)
同学，你好。我用荧光定量pcr 测出基因表达量后
发现其water空白组的表达量很高，想问下这可能是什么原因呢？
赞一下 回复此楼
2楼2018-08-22 14:48:32
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