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xiaorong-er

金虫 (正式写手)

[交流] 求助引物设计和基因序列

我想测一下鹌鹑肝脏CSD(半胱亚璜酸脱羧酶)和TauT(牛磺酸转运体)mRNA的表达量,但是现在鹌鹑的没有相关基因序列报道,我用小鼠或者人的CSD和TauT相关的引物进行PCR扩增是不是可以说明它们的表达情况呢?因为有人说它们的基因序列没有,我用别的动物的引物扩增出来也不能确认就是我要做的这个基因的表达情况,不知各位意见是怎么样的,希望给予参考,谢谢!
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xiaorong-er

金虫 (正式写手)

怎么没有人帮我出出主意呀
2楼2009-03-31 10:11:28
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
xiaorong-er(金币+2,VIP+0):谢谢 3-31 21:21
鸟类和哺乳类进化上走了不同路线,最好别这么冒险
你可以考虑用家鸡以及其他已经测过序的鸟类的基因序列的保守区域设计简并引物
去Ensembl看一下就知道了
3楼2009-03-31 11:46:45
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xiaorong-er

金虫 (正式写手)

只找到一篇是在鸡上面做的,他当初是考虑到鸡的CSD cDNA 序列没有,就根据人的和的设计的引物,但是这篇文章影响因子才0.6左右,之后也没有人报道鸡的CSD cDNA 序列,所以想想要是做鹌鹑的根据人家的引物去做是不是很悬的,我对这块还不怎么熟悉,今天提了几个样品的RNA,感觉还不错,不过还没有进行完整性检测。
4楼2009-03-31 21:32:39
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mimisikai

金虫 (小有名气)


xiaorong-er(金币+1,VIP+0):谢谢 4-1 10:53
有鹌鹑的其他基因报道吗?要是有,可以考虑扩两边,把这段基因带出来
5楼2009-03-31 21:52:02
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xiaorong-er

金虫 (正式写手)

这个我还没有查,估计也没有什么报道。
6楼2009-04-01 10:52:09
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