24小时热门版块排行榜    

查看: 1385  |  回复: 6
当前主题已经存档。

liujie5631

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】GV怎样把笛卡尔坐标转换成内坐标

用GV怎样把已经编写好的笛卡尔坐标文件转换成内坐标文件呢
请把过程说详细,我是新手,刚刚接触GV
非常感谢

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 18:53 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家



liujie5631(金币+1,VIP+0):xiexie 3-29 13:12
有两种坐标,一种像下面的为直角坐标,软件生成的,人手工编辑不了,
0 1
N                 -1.39340100   -0.02230100   -0.00019000
H                 -1.81921900   -0.27461600    0.88867300
H                 -1.87193300   -0.55969600   -0.71944300
H                 -1.62344000    0.95499500   -0.16574600
O                  1.57240000    0.10412000   -0.00002800
H                  0.59636200    0.01124300   -0.00233100
H                  1.89283600   -0.80878500    0.00039600
另一种为内坐标如下:
0 1
C
H                  1              B1
H                  1              B2    2              A1
H                  1              B3    3              A2    2              D1
C                  1              B4    4              A3    3              D2
H                  5              B5    1              A4    4              D3
H                  5              B6    1              A5    4              D4
O                  5              B7    1              A6    4              D5
H                  8              B8    5              A7    1              D6

   B1             1.07000000
   B2             1.07000000
   B3             1.07000000
   B4             1.54000000
   B5             1.07000000
   B6             1.07000000
   B7             1.43000000
   B8             0.96000000
   A1           109.47120255
   A2           109.47121829
   A3           109.47121829
   A4           109.47120255
   A5           109.47123134
   A6           109.47120255
   A7           109.50000006
   D1          -120.00000060
   D2           120.00003407
   D3          -180.00000000
   D4            60.00000799
   D5           -59.99998461
   D6           179.88890740
可以编辑,一般转换可通过GVeiw打开一分子坐标,保存对话框左下角一关建按钮write cartesians ,别的你自己要好好试试!说不清!
2楼2009-03-29 12:59:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liujie5631

木虫 (小有名气)

请大家帮忙啊
3楼2009-03-29 12:59:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhl213

金虫 (小有名气)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论 3-30 21:42
用gaussianview建立模型的时候,下面有个内坐标的选项,选上在保存一下,输入文件就是以内坐标的形式保存的了!
4楼2009-03-29 14:44:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家


★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论 3-30 21:42
那再告诉你一个诀窍,一般人我不告诉他,就是在输出文件里找到,
Final structure in terms of initial Z-matrix 对应的坐标就是优化过的内坐标了,别的我没辙了!
5楼2009-03-29 15:05:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论 3-30 21:42
用GV打开,保存的时候左下角有个选项,随你想存成什么坐标。
莫强求!
6楼2009-03-29 15:17:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liujie5631

木虫 (小有名气)

真的是十分感谢
7楼2009-03-30 14:12:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liujie5631 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见