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棒棒糖2012

铁虫 (正式写手)

[求助] 聚合物吸附有机物

各位大神,请教一个问题。利用MS模拟聚合物对有机物的吸附,已经利用重复单元建立处聚合物模型,我想请问在什么时候讲有机物与聚合物放在一起呢?是在Amorphous Cell构建盒子过程中?还是先构建聚合物盒子,再手动加入有机物?跪求大神指点迷津。
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棒棒糖2012

铁虫 (正式写手)

送红花一朵
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2楼: Originally posted by Adams_201 at 2018-06-29 07:24:26
一般像你说的重复单元建立超晶胞,然后建真空层,考虑在那个晶面或者健的位置添加吸附物,一般是计算小的分子或者气体。ammorphous 是构建介观表面,分子数比较大。amorphous cell,有模块添加方法,很快,你要是超算 ...

那请问是建盒子的时候就直接建聚合物和有机物的盒子吗?

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3楼2018-06-29 07:32:32
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Adams_201

银虫 (小有名气)


独孤神宇: 金币+1 2018-06-29 16:31:33
一般像你说的重复单元建立超晶胞,然后建真空层,考虑在那个晶面或者健的位置添加吸附物,一般是计算小的分子或者气体。ammorphous 是构建介观表面,分子数比较大。amorphous cell,有模块添加方法,很快,你要是超算服务器,可以试试!

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坚持,宽容,理解,完成
2楼2018-06-29 07:24:26
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月只蓝

主管区长 (职业作家)


独孤神宇: 金币+1 2018-06-29 16:31:43
有机物分子到底是手动添加还是用AC,主要是取决于有机物分子的个数。个数少,手动复制粘贴进去即可。个数多也可以手动粘贴,只要不嫌累,粘贴完做几何优化,不过此时最方便还是用AC来做。不管是用什么方法将两者放到一起,一般不会影响计算结果。

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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2018-06-29 09:50:11
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棒棒糖2012

铁虫 (正式写手)

5楼2018-06-29 15:56:50
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