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分子模拟新手

新虫 (著名写手)


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层结构,相互作用,需算什么
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建立了两层的结构,想计算其相互作用关系,
除了计算相互作用能,还能用ms计算哪些值,来证明其相互作用?
用ms,forcite 计算出来的  可以analysis哪些?
为什么我的很多都是灰色的,望各位指点

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may_gloomy

银虫 (小有名气)



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如果是单纯的两个层板,可以选择将可能产生相互作用的重复单元放置在一个晶胞里进行几何优化

优化后选取可能成键或有相互作用的原子来讨论,

不过建模的时候需要考虑溶剂化效应,层间是否存在其他原子等。

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10楼2018-06-13 08:41:24
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分子模拟新手

新虫 (著名写手)


还请各位指点  ,谢谢了

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3楼2018-06-11 19:37:39
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分子模拟新手

新虫 (著名写手)


4楼2018-06-11 19:37:47
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分子模拟新手

新虫 (著名写手)


9楼2018-06-12 11:01:33
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简单回复
2018-06-11 19:41   回复  
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qidingshu5楼
2018-06-11 19:39   回复  
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qunying126楼
2018-06-11 19:39   回复  
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