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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps中相同方法前后两次建立的模型在nvt下对应的压力差别对结果有没有影响？
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木棉和我

木虫 (职业作家)

[求助] lammps中相同方法前后两次建立的模型在nvt下对应的压力差别对结果有没有影响？ 已有1人参与

各位虫友好。用lammps做高温熔体的结构和相变。发现即便采用同样的方法建立非晶态模型，在同样的语句下（如fix 1 all nvt temp 4000 4000 0.1），前后两次建立的模型对应显示的压力差别很大，有1 000 000bar左右波动的，也有在10 000bar左右波动的。我想知道两次建模的模型下，对应压力差别这么大，其对模拟结果有没有影响？如果有，怎样消除这样影响？
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1楼 2018-06-10 23:05:53
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用 fix npt 控温控压。否则你无法控制压强。

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2楼2018-06-11 02:25:38
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木棉和我

木虫 (职业作家)
针对计算结构信息的情况，只用nvt是可以的，但是就会出现这种情况。

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3楼2018-06-11 02:33:45
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木棉和我

木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2018-06-11 02:25:38
用 fix npt 控温控压。否则你无法控制压强。

问题是npt和nvt不能同时联用啊。

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4楼2018-06-11 02:34:45
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 木棉和我 at 2018-06-11 02:34:45
问题是npt和nvt不能同时联用啊。
...

fix npt 是即控温也控压，实现等温等压系综。

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5楼2018-06-11 02:36:51
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brucefan

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【答案】应助回帖

另外，你不要太关注压强和温度的涨落是多大(如果你不是故意研究这些涨落)，而且要关注分块(例如每 ps平均一次)平均后的温度和压强变化趋势。画图也有助于自己和别人理解。

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6楼2018-06-11 02:40:55
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木棉和我

木虫 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by brucefan at 2018-06-11 02:36:51
fix npt 是即控温也控压，实现等温等压系综。
...

关注结构信息，很少看到在npt下统计的，一般都是在nvt或nve下统计。另外，如果上来就用nvt，那么显示的压力的大小好像与建模时设定的密度有关。如果设置的密度偏大，那么压力会特别大，就会出现out of range的情况。

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7楼2018-06-11 11:01:43
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木棉和我

木虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by brucefan at 2018-06-11 02:40:55
另外，你不要太关注压强和温度的涨落是多大(如果你不是故意研究这些涨落)，而且要关注分块(例如每 ps平均一次)平均后的温度和压强变化趋势。画图也有助于自己和别人理解。
...

我用的步长0.001fs，热力学信息每1000步输出一次，正好是1ps输出一次。如果算1ps下的热力学评论，可以设置每100步输出一次，导出后再进行评论？

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8楼2018-06-11 11:04:49
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木棉和我

木虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by brucefan at 2018-06-11 02:40:55
另外，你不要太关注压强和温度的涨落是多大(如果你不是故意研究这些涨落)，而且要关注分块(例如每 ps平均一次)平均后的温度和压强变化趋势。画图也有助于自己和别人理解。
...

樊老师。分块平均是数据输出后的后处理中完成，还是lammpsz中有命令可以直接输出分块的结果？
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9楼2018-06-12 16:25:32
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
木棉和我: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2018-06-12 18:02:22
引用回帖:
9楼: Originally posted by 木棉和我 at 2018-06-12 16:25:32
樊老师。分块平均是数据输出后的后处理中完成，还是lammpsz中有命令可以直接输出分块的结果？...

自己算就行。lammps只要输出数据即可。我是说你问问题的时候可以用图展示你的结果，不然问题太抽象。你最近问的几个问题都是简单的控温控压问题，那么你需要的是观察温度和压强的时间演化如何依赖于你的模拟参数。自这样你就会通过测试获得经验。

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10楼2018-06-12 17:44:32
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