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DNA序列上某段基因的启动子具体位置如何查找?
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wdd608
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DNA序列上某段基因的启动子具体位置如何查找?
已有1人参与
文献里的某个基因具体在DNA序列的哪段,以及基因的启动子、增强子啥的具体在序列中的位置怎么找??在NCBI或者其他网站可以找到吗?菜鸟求指点。感谢!
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2018-06-10 12:22:54
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用户晓晓
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
这个一般是没有具体的序列给你的,要知道基因的启动子两个方法:
1,使用软件预测:可以预测CPG岛,TATA box,RNAPOLL-II结合位点等来初步预测启动子位置
2,就是构建双荧光素酶报告系统,插入不同片段长度启动子,来验证启动子活性
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2楼
2018-06-10 17:55:15
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wdd608
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2楼
:
Originally posted by
用户晓晓
at 2018-06-10 17:55:15
这个一般是没有具体的序列给你的,要知道基因的启动子两个方法:
1,使用软件预测:可以预测CPG岛,TATA box,RNAPOLL-II结合位点等来初步预测启动子位置
2,就是构建双荧光素酶报告系统,插入不同片段长度启 ...
感谢回答,预测CpG岛知道用什么,初步预测启动子用什么软件来预测呀?TATA box,RNAPOLL-II、增强子这些只知道是转录需要的,这些结合位点怎么看?还请指点。
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3楼
2018-06-10 18:44:22
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