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木棉和我

木虫 (职业作家)

[求助] Parrinello-Rahman控压的方法在lammps中如何实现? 已有1人参与

各位虫友。文献中说:The chagnes in the atomistic structures associated with the glass transition of an Al2O3 supercooled liquid were analyzed by equilibrium MD simulations using the Nose-Hoover and the Parrinello-Rahman isobaric-isothermal thermostat. 温度制度是,3000K保温0.08ns,2.7ns内降温到300K。我想重现文献中的工作,但是不太清楚Parrinello-Rahman在lammps中如何实现?
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yxstbkl

铁杆木虫 (著名写手)

模拟的东西。原理搞懂就是好。

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2楼2018-06-08 04:59:07
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这基本上就是lammps中的fix npt的算法。仔细把手册的这部分完整地读一遍就明白了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2018-06-08 13:35:55
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木棉和我

木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by brucefan at 2018-06-08 13:35:55
这基本上就是lammps中的fix npt的算法。仔细把手册的这部分完整地读一遍就明白了。

我在想有可能是类似fix nvt+fix press/berendsen的弱耦合压浴?

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4楼2018-06-08 16:28:56
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
木棉和我: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2018-06-12 18:06:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by 木棉和我 at 2018-06-08 16:28:56
我在想有可能是类似fix nvt+fix press/berendsen的弱耦合压浴?
...

不是。这就是Brendsen方法,不是上面文献说的方法。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2018-06-08 20:23:40
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木棉和我

木虫 (职业作家)

谢谢,樊老师。我明白了即便是含press/berendsen的伪npt的系综,也不能看做npt。

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6楼2018-06-08 21:28:19
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包包波比

铁虫 (初入文坛)

楼主明白怎么使用P-R控压了吗,我最近也遇到了这个问题,可以交流一下吗
7楼2020-11-29 16:02:42
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