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心蔷1008

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子模拟 已有1人参与

求助各位大神，我已经在autodock中实现的分子对接，但是用pymol软件打开时不显示受体蛋白质，只有底物分子，请问原因是什么？怎么解决？

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1楼 2018-06-07 21:53:57
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

底物分子可能是尚未对接的，它的位置不在蛋白口袋汇总，pymol打开自动居中，所以只看底物，实际上蛋白不在界面视线范围内。推荐用DOCK 6做对接，百度搜索一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】计算教程，用浏览器访问，不用安装软件。一键提交，算完就有相互作用图，非常方便。
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2楼2021-12-29 14:44:27
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