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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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zouliuyong

新虫 (初入文坛)

[求助] DFT计算研究二氧化碳电化学还原机理已有1人参与

本科萌新,对这个真的不懂啊啊啊!!!毕业论文是DFT计算研究二氧化碳电化学还原机理,老师说先算卟啉,再算卟啉加金属铑,再算铑卟啉与二氧化碳结合,还原二氧化碳,已经用Gassuian09 DFT B3LYP算完卟啉的结构优化,但铑卟啉的结构优化算不出,后面的二氧化碳被铑卟啉还原也不知道怎么下手
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sgc8500

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

“铑卟啉的结构优化算不出”是为啥?我算过锌卟啉的
2楼2018-06-04 20:52:03
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zouliuyong

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sgc8500 at 2018-06-04 20:52:03
“铑卟啉的结构优化算不出”是为啥?我算过锌卟啉的

第一次接触这东西,一脸懵逼

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3楼2018-06-05 20:50:53
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sgc8500

新虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+5, 鼓励分享 2018-06-06 00:02:13
引用回帖:
3楼: Originally posted by zouliuyong at 2018-06-05 20:50:53
第一次接触这东西,一脸懵逼
...

去掉卟啉内环的两个氢,让铑与之成键,手动把位置调在中心附近。第一性原理计算并不依赖你标出的键来算,主要是原子距离。然后opt就好了

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2018-06-05 21:24:27
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zouliuyong

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by sgc8500 at 2018-06-05 21:24:27
去掉卟啉内环的两个氢,让铑与之成键,手动把位置调在中心附近。第一性原理计算并不依赖你标出的键来算,主要是原子距离。然后opt就好了
...

是四根键吧,然后那个基组,charge,spin啥的怎么选

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5楼2018-06-06 12:57:47
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heaven安风

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zouliuyong at 2018-06-06 12:57:47
是四根键吧,然后那个基组,charge,spin啥的怎么选
...

charge表示所带体系电荷数,spin表示自旋极化。可以简单查查,根据所算内容都比较容易确定。
别急,让我喝口水。
6楼2018-06-06 16:09:50
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dong5391

金虫 (著名写手)

江湖散仙

我思故我在
7楼2018-06-14 13:02:55
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黄花落

金虫 (正式写手)

要不你先教我一下DFT,等我有基础了咱们再来探讨一下

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8楼2018-06-19 00:06:23
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