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qewhuinqi

新虫 (正式写手)

[求助] 请问为什么会出现两个基因的CDS序列一模一样 已有2人参与

前人报道A基因只在那一个部位表达,其他部位都没有。但是我在另一个部位发现了一个和A基因的CDS一样的序列,这是怎么回事

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yanbodr

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

如果不是实验交叉污染的话,那就恭喜你拓展了前人的研究
2楼2018-06-02 11:21:59
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用户晓晓

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1,不确定你说的部位是否是指不同的组织或者同一组织不同的部位。如果这样的话,先要判断你扩增的那个基因与先前报道的是否是同一个基因(在染色体同一个位置)如果是同一个基因,那只是前人的研究结果不准确。

2,就是 要确定你和前人的基因到底是不是同一个基因。不同的基因有完全一样的CDS很正常的。很多基因在进化过程中会出现基因拷贝,这样就导致在染色体不同位置有编码相同蛋白的不同基因。根据你的描述你说CDS相同,那么久可以通过用你们不同的材料的cDNA来扩增这两个基因的非编码区。通过非编码区的比对来确定是否确实存在两个基因,还是这本来就是一个基因。(做实验之前可以先用CDS序列进行下blast,看下基因组上是否有两个位置都有完全的比对,如果是,那就说明这个基因存在完全一样的一个或者多个拷贝;如果不是,适不能说明这个基因不存在拷贝的,因为基因组序列并不是真理,可能存在组装错误,这时候就需要用试验来证明了)

祝试验顺利!
3楼2018-06-02 13:40:19
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