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Oswaldcui

金虫 (小有名气)

.。

[求助] voro++软件使用求解已有3人参与

大家好,本人最近在研究voro++的使用,使用环境是win系统下的Cygwin。

基本步骤如下:
1. tar 解压。  这个没有问题;
2. 在解压文件目录下 make。这个是编译吧?
3. 继续 make install。这个应该是安装程序吧?这一步我已经重复了好几次,截图如下:
4. 接下来就是要修改系统变量,用户手册里面的说法是:

A:- to use the command-line utility, the variable PATH should contain
  /usr/local/bin.
B:- to access the Voro++ man page, the variable MANPATH should contain
  /usr/local/man.
C:- to access the Voro++ header files, code compilation should include
  the flag '-I/usr/local/include/voro++'.
D:- to link to the static library, code compilation should include the
  flags '-L/usr/local/lib' to tell the linker where to look, and then
  '-lvoro++' to link to the library.

其中的C和D好说,就是修改mk文件,但是对于A和B,我试过了很多办法,
比如编辑修改.bashrc,cygwin.bat,bash.bashrc等等文件,但还是没有用,运行voro++总是提示找不到命令,截图如下。

所以在此询问大佬,第四部该怎么办才能找到voro++命令?
另外第四步成功了的话,就可以直接使用voro++  [option]来生成模型了吗?生成的是什么样的文件呢?

voro++软件使用求解
make install 截图


voro++软件使用求解-1
找不到命令
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Oswaldcui

金虫 (小有名气)

.。

引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2018-05-29 08:44:12
对了,关于生成模型的问题,请看安装包里的example...

多谢版主答疑,我重新检查了下home/hostname/.bashrc文件里添加的路径,修改成win系统下路径格式之后,就能成功的找到命令了,
至少目前 voro++ -h 命令可以正常运行。

我查看了examples里面的各种示例,发现每个示例都是一个cc文件和一个exe程序。那么请问:
1. 在cygwin里面怎么调用他们呢?直接运行exe倒是可以自动生成gnu文件。
2. cc文件里面,那一部分调用了voro算法呢?是  voronoicell v 这一行吗?不清楚这是哪里来的。。。附个截图如下,singlecell的cc文件。
voro++软件使用求解-2
single cell 代码

4楼2018-05-29 10:24:22
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查看全部 10 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
本问题的根本是楼主对linux操作还不够熟悉。voro++应该算是比较好安装的软件了。

1。关于安装。
make,是将软件在本目录下编译,make install是将编译好的文件安装到系统中。
请先用编辑器打开config.mk文件,你会发现有个PREFIX=/usr/local。这个语句的意思就是说在执行了;make install 之后,可执行文件会安装到/usr/local  这个路径下。因此,你可以把这个文件修改一下。
比如在自己的home下建一个名为voro的目录,就可以把这外语句修改为PREFIX=~/voro
2。关于运行
其实,上面在执行完make后,不用make install, 直接进入到voro的目录下的src中,运行 ./voro++就可以运行了。
如果使用了make  install ,那就到PREFIX指定的目录中去找,或将指定目录加入的..bashrc中。
2楼2018-05-29 08:09:27
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2018-05-29 08:09:27
本问题的根本是楼主对linux操作还不够熟悉。voro++应该算是比较好安装的软件了。

1。关于安装。
make,是将软件在本目录下编译,make install是将编译好的文件安装到系统中。
请先用编辑器打开config.mk文件,你 ...

对了,关于生成模型的问题,请看安装包里的example
3楼2018-05-29 08:44:12
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by Oswaldcui at 2018-05-29 10:24:22
多谢版主答疑,我重新检查了下home/hostname/.bashrc文件里添加的路径,修改成win系统下路径格式之后,就能成功的找到命令了,
至少目前 voro++ -h 命令可以正常运行。

我查看了examples里面的各种示例,发现 ...

A1:在编译voro的同时,也已在example下按照makefile的脚本对各个例子进行了编译,所以会出现。exe文件。在cygwin和linux下一样,用。/singe_cell.exe执行。
A2:是调用了 voronoicell v 这一行,具体算法在src里的cell.cc里。
5楼2018-05-29 14:22:27
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