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sincere32

木虫 (小有名气)

[求助] 设计用来检测扩增过程中生成的DNA和RNA的探针

还是实验设计阶段。
怎样检测扩增过程中新生成的RNA和DNA
我的设想是,
RNA只有一条链,假定记为+链,那么用+链检测到的只能是-链,就一定是DNA的信号。
而RNA转录的时候,启动子是没有的,DNA有启动子,启动子本身有20多nt,所以,启动子可以有一个探针去结合,RNA的序列也可以有一个探针,如果设计得合适,启动子的探针上接淬灭基团,DNA就不能给信号,给信号的就是RNA。
这两个信号可以是不同的荧光。
我不知道是否可行,如果是两个探针发生淬灭,要怎么设计。
相应的,如果有合适的探针,要做的预实验有
1 probe(DNA)+DNA做线性; probe(DNA)+RNA做本底。probe(DNA)+DNA+RNA
2 probe(RNA)+DNA做本底; probe(RNA)+RNA做线性。probe(RNA)+DNA+RNA
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