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新虫 (初入文坛)

[交流] 求助

想要做密码子分析,在NCBI中下载不到cds,于是下载了全基因组序列gbff文件,想要用getorf筛选显示文件太大,于是想要拆分,但文件太大了在电脑中打不开更没办法拆分(用的是word/txt),这种情况怎么解决呢,希望能得到一些建议和方案,感谢

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lixuenan

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1.可以下载notepad++看看应该可以打开
2.是否有linux版本软件 直接在linux上操作
2楼2018-05-25 09:47:14
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用户晓晓

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ensenmbl 网站   biomart 软件可以下载所有CDS。很方便!

另外 NCBI 同样是可以批量下载所有的CDS序列的!
3楼2018-05-25 14:58:43
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Echowwwwwww

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 用户晓晓 at 2018-05-25 14:58:43
ensenmbl 网站   biomart 软件可以下载所有CDS。很方便!

另外 NCBI 同样是可以批量下载所有的CDS序列的!

谢谢你的回答^_^ 但是我在这几个网站找了 并没有我需要的植物的cds文件可以下载 (在ncbi中我只寻找到一个测序版本的cds可下载,其余版本只有全基因组序列可下载 但我也需要其他版本的cds )

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4楼2018-05-27 16:28:10
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