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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 我想问一下，这样子我下面的实验应该如何？或者说我怎样才能确定这是新的种？
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Oooending

新虫 (初入文坛)

[求助] 我想问一下，这样子我下面的实验应该如何？或者说我怎样才能确定这是新的种？ 已有2人参与

分到了一个菌，公司给的16S rRNA测序结果上https://www.ezbiocloud.net/这个网站对比后，发现跟黄白链霉菌的similarity只有93.96，请这样算是一个新的种吗？如果不是，那算是什么？如果不能确定，我下一步应该怎么操作？建立系统发育树吗？如果是的话，是否能发分类方面的文章呢？本人微生物小新一枚，请各位大神多多指教，麻烦了，实在感谢！
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1楼 2018-05-22 15:18:03
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MicroShop

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如果序列对的，肯定是新种

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2楼2018-05-22 15:31:36
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Oooending

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by MicroShop at 2018-05-22 15:31:36
如果序列对的，肯定是新种

那请问如果确定是新种的话，后续应该怎么弄呢？可以发相关文章吗？
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5楼2018-05-22 15:41:51
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MicroShop

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潜在新属

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3楼2018-05-22 15:32:03
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Oooending

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by MicroShop at 2018-05-22 15:32:03
潜在新属

那请问如何确定呢？毕竟这样算是潜在，如何把它正式确定为新的呢？
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4楼2018-05-22 15:39:26
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MicroShop

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加我Qq

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6楼2018-05-22 15:47:09
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Oooending

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by MicroShop at 2018-05-22 15:47:09
加我Qq

请问您的QQ是多少呢？
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7楼2018-05-22 15:52:30
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MicroShop

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2560713482

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8楼2018-05-22 16:18:03
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议你再三确定一下你的序列是否完全正确，要知道，在链霉菌研究很多的情况下，发现一个相似度这么低的菌很难，请务必确认

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9楼2018-05-22 20:39:49
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三叶虫122

铁虫 (初入文坛)
这种亲缘93%，很常见，只能说没找到亲缘归属。但是不好说发表新种。想发表，必须手里有该属亲缘关系近的一定量的标准模式株作为对照，建立比对的系统发育树，还得有图片和一些该属的特别特征的辅助试验进行确定后才能确定新种，确定新种的工作量比较大，要搜集不少标准模式株，一旦搜集齐了，以后再做新种鉴定就会比较容易。要么你是权威，要么你手里有足够的标准模式株，其它的路子就不要想了。
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10楼2018-05-23 15:15:16
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