| 查看: 705 | 回复: 0 | ||
[求助]
GAUSSIAN AIMALL新手 求助优化问题
|
新手一枚，求大神相助！ 想要通过旋转两个二面角找到并分析氨基酸构象的影响因素，不太明白步骤，求大神相助！ 1.要先优化氨基酸分子构象，也就是用GAUSSIANVIEW 中的opt+freq 优化整体，找到minimum时的两个二面角的角度，但basis set是要用两种，并且做对比。 2. 分别固定二面角进行梯度扫面，从而得到一系列角度的wfn （1）在第二步中我发现在GAUSSIANVIEW中打开优化后的gjf文件，scan无法使用是为什么呢？ （2）我在坐标后输入以下代码，但运行不了是为什么呢 D 17 2 5 6 F 6 8 9 5 S 24 15 结果显示如下 # opt=modredundant B3LYP gen output=wfn --------------------------------------- 1/14=-1,18=120,19=15,26=3,38=1/1,3; 2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2; 3/5=7,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3; 4//1; 5/5=2,38=5/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1; 7//1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(2); 2/9=110/2; 99/6=100/99; 2/9=110/2; 3/5=7,6=1,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5,82=7/1,2,3; 4/5=5,16=3/1; 5/5=2,38=5/2; 7//1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(-5); 2/9=110/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1; 99/6=100,9=1/99; ------------------- Title Card Required ------------------- Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 C -2.35961 -0.15554 -0.12321 C -0.9355 -0.35527 0.32649 H -3.01446 -0.9594 0.29151 H -2.74879 0.83149 0.22582 H -2.42903 -0.18414 -1.23763 C -0.02176 0.721 -0.22092 H -0.88949 -0.34832 1.44767 H -0.5664 -1.35201 -0.03337 C 1.40234 0.52128 0.22885 H -0.06776 0.71404 -1.34207 H -0.38658 1.72685 0.11721 H 2.05737 1.32495 -0.18588 H 1.47161 0.54978 1.34328 O 1.90034 -0.74261 -0.21778 H 2.85802 -0.75121 -0.15164 The following ModRedundant input section has been read: Invalid Hessian diagonal element. 3. 我将wfn导入AIMALL得到划分后的能量，哪一部分才是最终结果，但不太会看数据求帮助 问题很多，谢谢大家！ |
回复此楼» 猜你喜欢
青基已中
已经有3人回复
-
散金币祈福
已经有186人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有257人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
-
深圳大学应用技术学院招聘凝聚态物理博士后
已经有110人回复
-
深圳大学2027级光电信息工程/物理学研究生推免
已经有66人回复
-
求助中医院临床中医中标的青年标书学习，谢谢
已经有4人回复
-
浙大物院表面物理课题组长期招收普博及直博学生
已经有257人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
