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lhf903金虫 (正式写手)
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土壤微生物总DNA的16S rRNA扩增子测序KEGG功能预测结果解释
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如题,做的样品是农田土壤微生物,分处理和对照两组样品; 提取土壤总DNA后,做了16S高通量测序,然后拿OTU Table做了群落功能预测(PICRUSt); 得到的结果用KEGG pathway (KO tier 2)展示,处理相对于对照: 氨基酸代谢(Amino acid metabolism, Metabolism of other amino acids)和外源物质降解、代谢(Xenobiotics biodegradation and metabolism)降低, 翻译(Translation)和转录(Transcription)上升。 不知道这样的结果,在环境样品研究中应该从什么角度去解释,主要是这几个功能本身的解释。 本人生物方面是外行,还请大牛帮助。 |
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