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xzwsw

银虫 (小有名气)

[求助] 宏基因组orf长度

各位虫友:
             想问一下宏基因组做序列拼接与基因预测,contig长度选择在500 bp以上是否可以,还是说必须要选在1000 bp以上的才能能说明问题?我论文中选的是500以上的,但有老师质疑说必须要选在1000以上的。非常感谢!(注:拼接软件用的是soapdenovo, 样品的n50都在1000以上,n90都在500以上)。再次感谢,希望有懂得大牛帮忙解答一下
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xliang88

木虫 (小有名气)

诗酒趁年华
2楼2018-05-09 20:57:12
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zyz2007

金虫 (正式写手)

3楼2018-06-11 09:46:25
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