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[求助]
宏转录组学求助
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| 想做植物内生菌宏转录组学，遇到一些问题，想求助各位大神。我们主要是想做植物根内生菌的宏转录组学，第一是直接考虑送根组织（可以较好的保护内生菌群的完整性）但是公司说，测序的时候植物对微生物的影响较大。我理解的是测序的时候会夹带一些植物自身的测序数据。我知道宏基因组学是在数据处理的时候是可以过滤掉植物基因数据的。但是转录组学不知道能否可以。还有就是自己通过研磨根组织，然后用微孔径的过滤膜把微生物过滤出来再提取，送公司进行测序。但是我理解的是这样处理会造成微生物的丰度破坏。再怎么过滤也会有植物的破碎组织。想请教各位我应该怎么处理较好呢。或者其他更好的办法，望各位推荐，不胜感激。 |
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