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雨后春笋！

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[求助] HCR杂交求助

请问，我设计了两个发夹，在NUPACK上两个发卡是不反应的，为什么买回来后，做凝胶电泳时，显示两个发卡杂交了？@biostar2009

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1楼 2018-04-30 17:12:09

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aishida

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★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-06 09:53:40

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2楼2018-04-30 17:47:28

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引用回帖:

2楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 17:47:28
可能原因：一是发夹稳定性不高，在溶液里自发打开了；二是溶液里的buffer成分没有足够的离子强度，被迫打开了；三是你的操作问题

感谢指导，如果是发卡稳定性不高的话，是不是只能重新设计发卡？如果是buffer离子强度不够的话，该如何改进呢？

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3楼2018-04-30 20:47:07

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aishida

禁虫 (职业作家)

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4楼2018-04-30 21:30:18

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4楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 21:30:18
如果是发卡本身不稳定只能重新设计，可以通过rna structure等类似网站预测结果稳定性；buffer成分可以考虑在tris体系里加点nacl或mgcl2等盐，ph7.5-8等稍偏碱性环境
...

谢谢指点，我用的buffer是PBS

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5楼2018-05-01 15:16:40

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