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雨后春笋!

银虫 (正式写手)

[求助] HCR杂交求助

请问,我设计了两个发夹,在NUPACK上两个发卡是不反应的,为什么买回来后,做凝胶电泳时,显示两个发卡杂交了?@biostar2009
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aishida

禁虫 (职业作家)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-06 09:53:40
本帖内容被屏蔽

2楼2018-04-30 17:47:28
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雨后春笋!

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 17:47:28
可能原因:一是发夹稳定性不高,在溶液里自发打开了;二是溶液里的buffer成分没有足够的离子强度,被迫打开了;三是你的操作问题

感谢指导,如果是发卡稳定性不高的话,是不是只能重新设计发卡?如果是buffer离子强度不够的话,该如何改进呢?
3楼2018-04-30 20:47:07
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aishida

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

4楼2018-04-30 21:30:18
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雨后春笋!

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 21:30:18
如果是发卡本身不稳定只能重新设计,可以通过rna structure等类似网站预测结果稳定性;buffer成分可以考虑在tris体系里加点nacl或mgcl2等盐,ph7.5-8等稍偏碱性环境
...

谢谢指点,我用的buffer是PBS
5楼2018-05-01 15:16:40
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雨后春笋!

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 21:30:18
如果是发卡本身不稳定只能重新设计,可以通过rna structure等类似网站预测结果稳定性;buffer成分可以考虑在tris体系里加点nacl或mgcl2等盐,ph7.5-8等稍偏碱性环境
...

你好,我想问问你,怎样看一个发夹的稳定性?我一直用的都是NUPACK,之前设计的两个发夹都是26个碱基,茎部一个八个碱基对,一个七个碱基对

发自小木虫Android客户端
6楼2018-05-05 17:44:16
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西樵9797

新虫 (小有名气)

请问您找到原因了吗?请求赐教

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7楼2019-08-18 20:09:04
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