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雨后春笋！

银虫 (正式写手)

[求助] HCR杂交求助

请问，我设计了两个发夹，在NUPACK上两个发卡是不反应的，为什么买回来后，做凝胶电泳时，显示两个发卡杂交了？@biostar2009
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1楼 2018-04-30 17:12:09
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aishida

禁虫 (职业作家)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-06 09:53:40
本帖内容被屏蔽
2楼2018-04-30 17:47:28
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雨后春笋！

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 17:47:28
可能原因：一是发夹稳定性不高，在溶液里自发打开了；二是溶液里的buffer成分没有足够的离子强度，被迫打开了；三是你的操作问题

感谢指导，如果是发卡稳定性不高的话，是不是只能重新设计发卡？如果是buffer离子强度不够的话，该如何改进呢？
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3楼2018-04-30 20:47:07
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aishida

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
4楼2018-04-30 21:30:18
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雨后春笋！

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 21:30:18
如果是发卡本身不稳定只能重新设计，可以通过rna structure等类似网站预测结果稳定性；buffer成分可以考虑在tris体系里加点nacl或mgcl2等盐，ph7.5-8等稍偏碱性环境
...

谢谢指点，我用的buffer是PBS
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5楼2018-05-01 15:16:40
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雨后春笋！

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by aishida at 2018-04-30 21:30:18
如果是发卡本身不稳定只能重新设计，可以通过rna structure等类似网站预测结果稳定性；buffer成分可以考虑在tris体系里加点nacl或mgcl2等盐，ph7.5-8等稍偏碱性环境
...

你好，我想问问你，怎样看一个发夹的稳定性？我一直用的都是NUPACK，之前设计的两个发夹都是26个碱基，茎部一个八个碱基对，一个七个碱基对

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6楼2018-05-05 17:44:16
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西樵9797

新虫 (小有名气)
请问您找到原因了吗？请求赐教

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7楼2019-08-18 20:09:04
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