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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » [求助]关于用Material Studio进行分子力学(MM)模拟计算
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kakaxisensee

木虫 (著名写手)

Prof. Dr.

[交流] [求助]关于用Material Studio进行分子力学(MM)模拟计算

请问怎么用Material Studio进行分子力学模拟计算啊？
应该用哪个模块？
我想模拟有机分子在金属表面的吸附情况

[ Last edited by aylayl08 on 2010-3-29 at 08:05 ]
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1楼 2009-03-21 13:50:53
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★
wuli8(金币+1,VIP+0):(*^__^*) 3-21 21:44
VAMP
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储氢家族欢迎储氢研究者！
2楼2009-03-21 14:36:17
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kakaxisensee

木虫 (著名写手)

Prof. Dr.
★
wuli8(金币+1,VIP+0):(*^__^*) 3-21 21:44
能不能说得具体一点啊？
怎么计算单点能？由于体系很庞大
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3楼2009-03-21 16:54:26
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fyz_ok

金虫 (正式写手)
★
wuli8(金币+1,VIP+0):(*^__^*) 3-21 21:43
对大的体系好像应该用discover吧
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4楼2009-03-21 18:58:10
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ccwhhs

铜虫 (正式写手)
你可以先找一些文献来看看，看别人是怎么计算的，用的什么方法，用的哪个模块，怎么设置，然后下一些这个模块的帮助文件，就可以了。
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5楼2009-03-22 07:35:59
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madonion

金虫 (正式写手)
★
wuli8(金币+1,VIP+0):(*^__^*) 3-22 22:51
2楼的同学，vamp是半经验模块阿，没有mm.
mm可以用discover和forcite模块。
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6楼2009-03-22 09:52:55
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zwprxiantao

银虫 (小有名气)
★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):3X!欢迎常来小木虫(*^__^*) …… 3-25 21:49
discover
forcite
都可以进行分子动力学计算。
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我是一匹狼
7楼2009-03-23 16:57:58
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zwprxiantao

银虫 (小有名气)
★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):3X!鼓励新虫！(*^__^*) …… 3-25 21:48
castep也可以进行ab 分子动力学计算，但是能计算的体系很小。
你肯定不合适了。
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我是一匹狼
8楼2009-03-23 16:59:28
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kakaxisensee

木虫 (著名写手)

Prof. Dr.
在用discover进行大分子动力学计算时老是出现错误怎么办？
Failed to add energy server contribution to the Job.
Failed to prepare structure for a forcefield based calculation.
The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 12 atoms.
The charging engine has failed to calculate a charge for 12 atoms.
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9楼2009-03-30 22:48:49
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qasd

木虫 (著名写手)
★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q！ 期待更多讨论！ 3-31 17:18
力场选的不好，有的原子没有合适的力场参数
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10楼2009-03-30 22:51:52
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