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生物药学

新虫 (小有名气)

[求助] 16sRNA上下游测序结果如何拼接 已有2人参与

请问大家,16sRNA分别用上下游引物测序,得到2段序列,如何将其拼接成一个干净的16sRNA?

@天使托 发自小木虫Android客户端
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平静的海洋

木虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
现在一般是测部分可变区,这部分区域的长度是可以测通的,就是说reads1和reads2之间有一段重叠,根据overlap拼接
2楼2018-04-28 13:36:15
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
测序的时候他们应该是设计好的,可以有overlap,如果给你的数据是两部分,可以自己用DNAMAN等软件拼接,也可以找公司要一个拼接好的序列
···
3楼2018-04-28 13:52:24
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

其实word就搞定了,正向反向互补一下一对比,搞定

发自小木虫Android客户端
4楼2018-04-28 18:03:28
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